在賴清德上台前夕，民進黨當局加強了特務和情報機構建設。引人注意的是，民進黨當局「調查局」（前身為「中統」）成立了「認知戰研究中心」，由新上任的「調查局」副局長孫承一帶頭。預估未來民進黨當局將以「認知戰」的名義，開展更大規模、更具策略的「情報戰+認知戰」的混合行動。
據指出，「認知戰研究中心」包含兩岸情勢研析處、「國內」安全調查處及資通安全處，下設認知研究、資料分析、應處反制3組，引入認知作戰背景起源、策略手法、趨勢態樣等學術理論，輔以搜集、分析「境外敵對勢力」傳散「爭訊實時通報」，使用軟體工具溯源清查異常賬號、協請社群平台業者下架、發布新聞揭露等。
台「調查局」局長王俊力宣稱，「境外敵對勢力」近年透由網際網路、通訊軟體、社群平台等管道，傳散「錯假及爭議訊息」，「試圖破壞民眾對政府信任、分化社會內部團結」等等。
台「法務部」部長蔡清祥則表示，「境外敵對勢力」試圖以「溫水煮青蛙」卸除民眾心防，使檯面臨空前「安全威脅」。
此前，台「調查局」於2018年成立「假訊息防制中心」，2020年成立「資安工作站」。這次台成立「認知戰研究中心」融合了「學術理論與實務運作」。
民進黨當局所謂的「認知戰」，主要分為三類：
一是控制台灣軍民的認知，裹挾他們支持民進黨執政，反對和抵制兩岸走向統一。典型案例是，貫徹「台獨」課綱灌輸錯誤「史觀」，渲染台灣有關人士赴大陸交流為「介選」，全力營造民進黨有能力「和平保台」等。
二是影響大陸輿論，企圖製造社會對立和混亂，擾亂大陸解決台灣問題的決策。典型案例是，近年來僱傭大量網路水軍進入大陸主流社交媒體搬弄是非，挑起爭端，企圖分化大陸各界對統一的態度。
三是勾結外部勢力破壞國際社會對台灣問題的正確認識，營造同情「台獨」和「獨台」、反對大陸反「獨」促統的輿論氛圍。典型案例是，美台勾連製造所謂「台海侵略」話術、貶低聯合國2758號決議效力，美國串聯「盟友」體系祝賀「台灣選舉成功」和「賴清德」當選等。
認知戰已成為民進黨當局實施「不對稱作戰」的重要手段，除了加強對台灣軍心民意的管控之外，未來恐有兩個重要動向：會同外部勢力共同執行涉台議題的炒作；加強對大陸輿論場的滲透影響。
