中國現在有兩處揚子鱷自然分布區，分別位於安徽的宣城地區和浙江的長興地區，都建立了自然保護區，前者為國家級，後者省級。雖然揚子鱷數量不多，但都是殘留分布區，物種與環境適合性好。
保護本應是有針對性消除影響大的人類活動，為揚子鱷解除物種瀕危創造有利的環境條件，至於夏天是否太熱、冬天是否太冷，揚子鱷能否適應、如何適應，不應是保護要考慮的問題。因為揚子鱷是古老物種，歷史上的冷熱不知經歷了多少個回合，現在正常的四季輪迴不是障礙。
可是，我們在保護中卻都發展出了冬天把揚子鱷請進暖房過冬，春天再從暖房搬運到室外的措施。尤以安徽揚子鱷保護區動作最大，每次搬進搬出媒體差不多都作為重大保護舉措悉心報道，看到搬運人員泥里水裡抱著個凶神惡煞的揚子鱷也很辛苦。揚子鱷可能也不好受，防咬傷工作人員必須捏牢其嘴巴（吻），裝滿一車拉走，第二年開春循環往複。
揚子鱷是冷血動物，環境氣溫較低時它們就會躲到洞穴中冬眠，冬眠時長可達5個月。那我們為什麼不創造條件讓他們自然冬眠，卻以人工暖房代替洞穴，這不能不令人感嘆，如此保護法保護的還是野生動物嗎，就算是，世世代代可否堅持得了？保護野生動物，不應該干預、改變其生存對策，否則便成了馴養，要有這個分際。
今天看到本月初浙江新聞對長興揚子鱷的報道，標題雖然用的也是寒潮來襲揚子鱷住進「暖房」，但此暖房非彼暖房，其中之一非常接近自然，或者就是自然。說的是飼養員手持稻草沿池塘巡邏，找到土層較薄的鱷魚洞穴，給加蓋稻草為冬眠的揚子鱷保暖。其實這也不用，但人們顯愛心也無妨，不管怎麼樣並未改變其野外冬眠的習性。如果大家對揚子鱷野外自然越冬不放心的話，這個做法可以學習借鑒。
長興也有越冬室，有大些的，也有很小的，室內溫度人為調控，這就不是自然越冬了，可喜的是有一部分在自然越冬。人工繁育打破了揚子鱷自然繁育時間，冬季了還有大批手掌長度的幼鱷，野外肯定無法過冬。同時，人工飼養在水泥池子里，即使成年揚子鱷也無法打洞。這都決定了不得不給揚子鱷越冬配備暖房、人工轉場等。野生動物保護搞得太複雜，人工代價很大，野生動物可能也高度退化中。
《生物多樣性公約》強調物種野外生存能力的可持續性，我們內心肯定也是保護野生動物，生態文明理念要求尊重自然、順應自然，國際上也提倡以生態系統方式保護自然，具體到揚子鱷就是該進洞穴要進洞穴，該冬眠要冬眠，要托著其習性搞保護，而不能改變其習性以示保護。建議各有關方面進一步提升保護揚子鱷的價值追求，尊重其習性，力爭有更多的揚子鱷在野外自然越冬，逐步取消人工越冬，使揚子鱷真正成為生態系統中的揚子鱷。
