清華大學由中華人民共和國教育部直屬，位列「211工程」、「985工程」，入選」珠峰計劃「、」2011計劃「、」111計劃「、」卓越工程師教育培養計劃「、」卓越法律人才教育培養計劃「、」卓越醫生教育培養計劃「，是C9聯盟、東亞研究型大學協會、環太平洋大學聯盟、清華—劍橋—麻省理工學院低碳能源大學聯盟成員，中管副部級建制。
清華大學是中國乃至亞洲最著名的高等學府之一，2位共和國主席、7位中央政治局常委、14名兩彈一星獲得者、600餘名院士從這裡走出，王國維、梁啟超、陳寅恪、趙元任等一大批學術巨匠曾在此執教，在長達百年的辦學歷史中，「自強不息、厚德載物」的清華深切影響著中國近現代發展進程，為社會繁榮、國家富強作出了廣闊遼遠、歷久彌新的重要貢獻。
清華大學的前身是清華學堂，始建於1911年，當時是由美國「退還」的部分「庚子賠款」建立的留美預備學校。1912年，清華學堂更名為清華學校(因為該大學所在地原為清代的皇家園——「清華園」。所以就以園名作為大學名了)，1925年設立大學部，開始招收四年制大學生，並開設研究院。1928年更名為「國立清華大學」，擁有文、法、理、工等院系。
1900年，中國的庚子義和團運動引致八國聯軍武力干涉。1901年9月7日上午，清廷全權代表奕匡力和李鴻章與11國代表，在最後協定書上簽字，簽下了將中華民族推入苦難的《辛丑條約》。 辛丑條約》第六款議定，清政府賠償俄、德、法、英、美、日、意、奧八國及比、荷、西、葡、瑞典和挪威六「受害國」的軍費、損失費等款項本息合計 九億兩白銀，由1902年起至1940年止，分39年還清，以海關、常關及鹽政各進款作抵押，按照條約所列辦法及匯率，摺合各國貨幣償付，是為「庚子賠款」。其中俄國以出兵滿洲，需費最多，故所得額最大，為1億3037多萬兩。中國當時的人口大約45000多萬人，庚子賠款每個中國人被攤派大約一兩銀子。庚子賠款，超過以前所有賠款之總和，至此，中國財政、經濟全面破產。近代中國向帝國主義國家總共支付的戰爭「賠款」為16億多兩白銀。在所有對中國發動侵略戰爭的國家中，日本掠奪中國的財產最多。 1901年簽定的《辛丑條約》中規定，清政府向西方八國共賠款白銀4億5千萬兩，美國應得到其中的3200多萬兩，摺合美金2400多萬元。 1906年3月6日，美國傳教士明恩溥在白宮向西奧多·羅斯福總統建議，用清朝政府的「庚子賠款」在中國興學和資助中國學生來美國留學。在明恩溥等人推動之下，羅斯福總統向國會提出贊助中國教育的諮文，1908年5月25日由國會通過。 1908年，美國正式宣布退還「庚子賠款」的半數，計1160餘萬美元給中國，作為資助留美學生之用。為了開展派遣留美學生工作，清朝政府於1911年在北京開設了清華留美預備學校，1924年改名為「清華大學」。
為嘗試人才的本地培養，1925年設立大學部；1928年更名為「國立清華大學」。1937年抗日戰爭爆發後，學校南遷長沙，與北京大學、南開大學聯合組建「國立長沙臨時大學」；1938年遷至昆明，改名為「國立西南聯合大學」；1946年遷回北京清華園原址。
