2023年2月17日,西湖大學施一公及張曉峰共同通訊在nature communications 在線發表題為「mechanisms of the rna helicases ddx42 and ddx46 in human u2 snrnp assembly」的研究論文,該研究揭示了人u2 snrnp 組裝中rna解旋酶ddx42和ddx46的作用機制。該研究報道了ddx42-sf3b複合物的冷凍電鏡結構和含有ddx42 (ddx42-u2複合物)的17s u2 snrnp的組裝前體。ddx42通過n端序列錨定在sf3b1上,其n-plug佔據sf3b1的rna通路。ddx42與sf3b1的結合模式與ddx46的結合模式有著驚人的相似。
在ddx42-u2複合物中,ddx42的n端仍然錨定在sf3b1上,但解旋酶結構域已被u2 snrna和tat-sf1取代。通過體外實驗,作者發現ddx42和ddx46在與sf3b的結合方面是互斥的。sf3b1的癌症驅動突變靶向rna路徑中直接與ddx42和ddx46相互作用的殘基。這些發現揭示了ddx42和ddx46在17s u2 snrnp組裝中的不同作用,並為sf3b1癌症突變的機制提供了見解。
另外,2023年1月13日,西湖大學施一公、黃高興宇及曾超共同通訊在current opinion in structural biology 在線發表題為「structure of the nuclear pore complex goes atomic」的綜述文章,該綜述總結了最近在破譯npc分子細節方面的進展,這些進展在快速發展的冷凍電鏡技術、x射線晶體學和機器學習支持的結構預測方面得到了極大的進展。最近在冷凍電鏡(cryo-em)重建、機器學習支持的結構預測和生化重建方面的突破結合起來,以前所未有的精度生成了npc的分子模型。此外,在細胞冷凍電子斷層掃描(cryo-et)結構揭示了npc的實質性結構動力學。這些進步使npc大的組織原則和職能更加清晰。
2023年1月2日,西湖大學施一公團隊在cell research(if=46)在線發表題為「lilrb3 is a putative cell surface receptor of apoe4」的研究論文,該研究表明lilrb3是apoe4的假定細胞表面受體。該研究證明apoe4,而不是apoe2,特異性地與白細胞免疫球蛋白樣受體b3 (lilrb3)相互作用。lilrb3胞外結構域(ecd)的兩個離散免疫球蛋白樣結構域識別apoe4的n端結構域(ntd)上帶正電荷的表面斑塊。該原子結構揭示了兩個apoe4分子如何特異性地與兩個lilrb3分子結合,通過形成異質四聚體複合物將它們的細胞內信號基元靠近。與生化和結構分析一致,apoe4,而不是apoe2,以lilrb3依賴的方式激活人類小膠質細胞(hmc3)進入促炎狀態。總之,該研究確定lilrb3可能是apoe4的免疫細胞表面受體,而不是apoe2,這可能有助於理解apoe亞型的生物學功能和疾病相關性。
最後,inature編輯部結合pubmed及web of science發現施一公團隊從2014年到2023年(截至2023年3月23日)在nature (4篇),science (14篇),cell (7篇),cell research (9篇),pnas(15篇),nature communications (3篇),protein cell (3篇)及current opinion in structural biology (5篇)等發表76篇文章(包括綜述及研究論文,通訊作者的有68篇文章)(文章後附列表),專註於剪接複合物,核孔複合物及分泌酶等的結構解析。另外,由於時間匆忙,如有錯誤,可向編輯部反饋。
76篇文章列表如下:
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