首先，人的生理功能需通，通則氣化，化則健。人是以五臟為中心的有機整體，人的生理功能以臟腑為核心。五臟主藏精氣而不瀉，實則藏中有瀉。如心主血脈，血液貴流通；肝主疏泄，性喜條達，能調暢氣機，疏泄情志；脾主運化，脾氣主升；肺主氣，主宣發肅降；腎藏精，主骨生髓通腦等功能都有藏中寓瀉的功能。六腑傳化物而不藏，實則是瀉中有藏。
如胃的受納腐熟水谷功能，稱胃為水谷之海，胃氣主降；膽為中清之腑，助肝疏泄，助脾運化；小腸受盛化物，分別清濁；大腸的傳導燥化功能；膀胱儲尿排尿；三焦納諸臟器，是元氣匯聚通行之所等，都是瀉中寓有藏的功能表現。因此，臟與臟，腑與腑，臟與腑之間都需要協調平衡，才能維持。
人體對飲食物的正常受納、消化吸收過程來保證機體的正常生理功能活動。以五臟為中心的有機整體，還包括氣血、經絡、陰陽等。氣血是構成人體的基本營養物質，氣血貴流通，氣順血和，則人體健康。經絡在人體無往不達，將人體聯絡成一個有機整體。經絡之氣暢通貫注，以運行氣血，溫煦臟腑。陰陽是對物質和功能的概括，也是所表現出來的生理現象。物質為陰，功能為陰，功能為陽。
物質與功能，即陰與陽，相互依賴，彼此交通，相互為用。總之，臟腑協調平衡，陰陽相交，經絡暢通，氣血貫注，循環往複，方可維持人體正常的氣化功能，化則健，承乃治。生理功能如此，醫者必須通曉。
二是發病的機理在於不通
人在各種致病因素的影響下，就會導致臟腑失和，氣血失調，陰陽乖戾而產生疾病。如氣血運行受阻，輕則氣滯氣鬱，久則氣滯血瘀或氣機上逆而發生氣逆；氣血虛少，則發生氣虛、血虛、氣血兩虛，氣虛無力運血，亦可產生氣虛血瘀氣虛日甚，還會導致中氣下陷，不能固攝內臟而致內臟下垂等症。陰陽失調就會產生寒熱證。陽盛則熱而產生實熱症，陰盛則寒而出現虛熱證。臟腑失和，主要是產生臟腑病變，即內傷雜證。如心繫病、肺系病、脾胃病變、肝膽疾病、腎系病等。由於五臟主藏精氣，其主要功能特點是藏而不瀉六腑轉化物，其主要功能特點是瀉而不藏。臨床上，臟病多虛證，以脾虛為代表；腑病多實證，以胃家實為代表。故有「實則陽明，虛則太陰」之說法。
總之，疾病發生後是千變萬化的，且病情的變化又如是錯綜複雜而多變的。因此，醫生應全面掌握各種疾病的發病機理及其變化規律，如病因、病機、病位、病性、病勢等各方面都應通曉，然後才能有的放矢，討論疾病的治療。
三通是治療疾病的基本原則
人的生理平衡失調就會導致疾病的發生，人生了病就必須採取及時有效的治療措施，才能恢復平衡，得到康復。一個臨床醫生應通曉從理、情理、文理、哲理、醫理，乃至天文地理，方可談醫，才不至貽誤病情。具體治療時，更應通曉藥理，然後根據病情，處方法度，選方遣葯。葯是補偏救弊的，良攻切不可亂投藥物。
①通曉人理人有男女老少之別，陰陽稟性有剛有柔。同是男人，有的身高體壯，有的身矮體弱，有的胖，有的瘦。肥人氣虛多談濕，瘦人陰虛多內熱；同是女人，有月經期、妊娠期、哺乳期的特點，除開經、孕、產、乳的生理特點外，余同男子。陽剛之人易動怒，傷肝氣；陰柔之人多憂鬱，易損心脾。若為七情內傷，雖各有所傷之臟腑，終會相互影響而形成相乘相侮發病。治療則應根據人理之不同而採取相應的辯證治療，方可適得其體而發揮最佳療效。故李中梓提出「不失人情論」，強調因人制宜。
②通曉文理醫學本身就屬於文化科學之一，在古文化中，醫學知識佔了很大比例。如在古代或近代15世紀中期以前，學生所讀課本之一部分就是醫學書籍，故常說「秀才學醫，籠內捉雞」。一是說明這個學生在讀書階段已經學習了很多醫學知識，稍加專修就成；二是說明有文化的人學醫不難，易於明白理解。無文化的醫生是盲醫。沒有文化知識為基礎，怎能通曉高深的醫學知識？更無法談提高。依樣畫葫蘆，停滯不前。文化知識較高的人，多能圓機活法，靈活多變。正如孫思邈教導學生所說「行欲方而智欲圓」。歷代以來的醫學家，都是即懂醫理，又明文理，醫文並茂的醫學家、文學家，如張仲景、孫思邈、李時珍等輩。
③通曉哲理中醫的陰陽五行學說，本身就是我國古代樸素的哲學思想，被古代醫學家運用於中醫學中來說明人的生理、病理現象。如《素問 陰陽應象大論》說：「陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，變化之父母，生殺之本始，神明之府也」。中醫診治疾病，離不開辯證論治。「辯」、「論」就是運用邏輯思維的方法對疾病進行探討，通過分析、推理、判斷，最後得出結論。醫生不懂哲理，常是辯證不準確，論治不合病情，處方無邏輯性，雜亂無章。一個處方動則十幾味，幾十味葯，抓起來一大包，體現不出理、法、方、葯的邏輯性和治療的真結所在，當然臨床療效就無從去很好實現，甚至無療效，乃至延誤病情。用這種方法去治療疾病，即延誤病情，影響病人的身體健康，又浪費了藥物資源，好處只有一點，就是多賣葯多賺了一點錢，實乃不可取也。懂哲理的人，圓通活法，邏輯思維，遇事不慌，處理有序。哲理通醫理，用藥合理合法，則能治病救人，普救蒼生。
④通曉天文地理人生活在自然界中，人與天地相參。人不能脫離大自然而生存，並受其自然之影響。中醫病因學中的六淫就是自然界中六氣的反常，當人體抗病力下降時使人生病的外因病邪。人感受外邪後易致外感疾病，外感疾病多有季節性，說明疾病在一定程度上受季節氣候的影響。疾病的發生又與區域有關，如南方氣候偏熱多潮濕，其病多濕熱，用藥宜清泄；北方氣候寒冷，其病多偏寒，用藥宜溫散。《內經》有「順之則痾疾不起，逆之則災害生」的論述。說明人要適應自然，才不生病或少生病。故治療疾病時，應因時因地制宜，所謂制貴權變。
⑤通曉醫理醫理是醫務人員必須具備的基本素質條件。醫者，藝也：理即哲理、道理、規律、理論、理性。通曉醫理，就是要全面懂得醫學理論和規律，並能運用於防治疾病的醫療技術。若能將理論與臨床實踐相結合，立起沉痾，便是較高的醫療技術。醫理，包括醫學基礎知識和臨床技能，如藥學、解剖學、生理學、病理學、中醫方劑學、診斷學及內、外、婦、兒等科學。這些理論和技術需要系統學習和深究，必須全面把握，靈活運用，做到功多藝熟，熟能生巧，方可為良醫。不明醫理，便去草率診治疾病，豈不是信口雌黃，瞎亂一通，何能治病救人、立起沉痾？！
對於醫理，孫思邈經常教導學生要「博極醫源，精情不倦」，做到「大醫精成」。廣讀醫書，深探其中的奧妙原理，借鑒古人經驗，結合自己的心得體會，融會貫通。由理論到實踐，再由實踐到理論，經過多次升華，最後變為系統理論和高超技藝。病有千變，法亦萬主變。要能合法生活法，必須先通曉醫理，把握疾病發生髮展變化的規律，洞察一切，然後才能有的放矢，順理成章，立起沉痾。
疾病的發生雖有內因、外因之分，但其主要發病機理在於「不通」，外因多是邪氣阻滯不通，內因多是臟腑、經絡、氣血失調不通，都可破壞人體正常的生理功能，使平衡失調而生病，故治療疾病變應因勢利導，通之，治之。關於通之之法，《醫學新傳》小結為：「夫通者不痛，理也，但通之之法各有不同，調血以和氣，通也；上逆者使之下行，中結者使之旁達，亦通也；虛者助之使通，寒者溫之使通，無非通之之法也。若要以下泄為能，則妄矣」》這是對治病亦通的全面理解，可謂經驗之談。
總之，從生理、病理，到醫理、藥理、治療，都必須從理論到實踐通曉之。只有精通明了，才能正確認識人體的生理、病理及疾病的變化規律。即能掌握理論，又能駕馭疾病，方可擔當救死扶傷、治病救人的神聖職責。因此，「萬病惟求一通」.
