我們上期盤點了さかみはら色的同人作品《聖鬥士宙斯篇》和《聖鬥士混沌篇》的世界觀設定。
而天界驚詫於雅典娜聖鬥士的實力，居然先後擊敗了海皇和冥王，於是宙斯決定假意向雅典娜開戰，即“創世紀”計劃，繼續試煉雅典娜和聖鬥士。宙斯以神力復活領悟第八感的聖鬥士，包括白羊座的穆、雙子座的加隆獅子座的艾奧利亞、處女座的沙加、天秤座的童虎及天蠍座的米羅等，阿波羅也將五小強傳送回大地。
此時處女座黃金書聖鬥士沙加參透了自己第七使徒光明神靡菲斯特的身份，阿波羅要求沙加返回天界，沙加依然決定效忠雅典娜，第十使徒月影神米拉趕來準備懲處“叛徒”，結果被沙加擊殺，正式拉開了雅典娜與宙斯間的“聖戰”。
而第十三使徒火炎神浮士德也就是鳳凰座一輝，也拒絕了第八使徒木羅神阿里昂的徵召，雙方展開大戰。因為冥王哈迪斯戰敗後被天界封印於諸神的墓地—冥蓬域，而敵人的敵人就是朋友，所以冥界三巨頭出手協助一輝，遭到木羅神反殺，最終一輝恢復第九感神識，殺死了木羅神。
此時天帝阿維爾也降臨人間界，他曾將大地的管轄權交給雅典娜。阿維爾拿出具有弒神之力烏拉諾斯之劍，讓雅典娜選擇放棄大地，或者殺死天帝阿維爾繼續反抗宙斯。雅典娜不忍心殺死心愛的兄長，接過烏拉諾斯之劍準備自殺，阿維爾阻止了雅典娜，並自盡，堅定了雅典娜反抗宙斯的決心，阿維爾神之血讓雅典娜神衣進一步覺醒，雅典娜實力大增。阿維爾的忠實部下第五使徒水滸神和第六使徒金剛神將阿維爾“遺體”帶回天界。
得到消息的冰河與紫龍踏上征程，沒想到十二使徒聖命神安塔利斯居然解除了童虎的諸神的假死法，導致童虎灰飛煙滅了，悲憤的紫龍領悟第九感擊殺了聖命神。
戰軍神斯波爾圖斯派出嘉利美特三騎士試探黃金聖鬥士實力，結果分別被加隆、穆、米羅擊殺，後來加隆與戰軍神同歸於盡，而穆、艾歐利亞和米羅以雅典娜之驚嘆與假扮沙加的土烈神艾修塔同歸於盡。
這期間青銅五小強和支援而來的海魔女、奧路菲殺掉了不少普通天鬥士，天界先遣部隊基本被消滅，聖鬥士大軍準備進攻天界。
雅典娜率領沙加和五小強啟程進攻天界，天界目前還有天界三妃（天后·赫拉、智慧與美之女神·亞提密斯、愛與調和之女神·美利露提亞）和前三名神帝（太陽神阿波羅、冥麗神黛里斯普羅托、海雄神特里頓）鎮守，實力遠超聖鬥士。
因為除一輝外，其他四小強沒有“天上人之證”身份，所以迷失在超空界，關鍵時刻，原第四使徒大地神伊卡洛斯，也就是射手座黃金聖鬥士艾俄洛斯化身的飛鳥將他們引入天界。
鎮守天空域的阿維爾已自盡，他的兩名忠實部下，水滸神勞倫士和金剛神亞維奧搭起彩虹階梯，將眾小強送到海樓域，冰河對戰同樣使用凍氣的海雄神特里頓，冰河的絕對零度落敗於海雄神的超絕對零度，這時海皇波塞冬趕來支援，這海雄神原是海皇波塞冬麾下第一任海龍將軍，被海皇派到宙斯身邊做卧底，結果執掌天界聖海野心膨脹的海雄神背叛了波塞冬，兩人最終同歸於盡。而冰河也破冰而出，掌握了超絕對零度。
瞬單挑掌管冥蓬域的冥麗神黛里斯普羅托，掩護紫龍和星矢到太陽神殿，瞬逐漸不敵的關鍵時刻，一輝趕來，兄弟齊心，其利斷金，此時封印在冥蓬域的哈迪斯神識附身在瞬身上，與一輝兩人合力擊殺了冥麗神。
到達太陽神殿的星矢和紫龍想採用老套路，一個拖住阿波羅，另一個闖“日輪門”進入宙斯神殿，可惜“日輪門”與阿波羅小宇宙關聯，星矢和紫龍接近“日輪門”時，聖衣直接融化成水，趕來的冰河趕忙施展超絕對零度救援，反彈的熱浪將冰河的聖衣一併融化，此時，一輝和瞬也趕到了，五人再次因雅典娜之血覺醒了神聖衣。
五小強群戰阿波羅，使阿波羅負傷，作為曾經的掛王，阿波羅也覺醒了最強神之力，天衣直接覺醒為主神級別的神衣，最終以一輝和紫龍陣亡的代價，保障了星矢、冰河、瞬通過了“日輪門”。之前沙加也護送雅典娜一路殺到太陽神殿，結果也是死於阿波羅之手，實際上阿波羅看到了聖鬥士捨生忘死的決心，存在一定的放水行為。
月神在天上界入口布置了防禦部隊，冰河和瞬施展了合體必殺技“鑽石風暴”打散了防禦部隊，為星矢開路，面對漫山遍野的側近天鬥士，星矢也體力不支倒地，冥界潘多拉放死去的黃金聖鬥士靈魂過去激勵星矢。
在奧林匹斯山宙斯神殿，雅典娜與赫拉的對話，揭示了實際上一直以來，都是赫拉在幕後操縱挑起聖域之戰、與海界和冥界之戰，這段情節車田正美設置的是死睡二神的妹妹命運女神刻爾操縱的。雅典娜的神衣因阿維爾鮮血而覺醒，輕鬆擊敗了赫拉。
天馬座聖鬥士星矢終於陪着雅典娜進入神殿見到了宙斯，宙斯也揭示了親自發動創世紀的真實原因，並不是為了毀滅大地，而是為了篩選對抗混沌皇帝卡奧斯的人選，見到闖關而來的星矢非常欣慰。
這時所有人都在等待星矢大戰宙斯的結果，大家相信弒神大魔王可以再次完成弒神壯舉。實際上冥王三巨頭、阿波羅、天帝阿維爾等實際上都活着，宙斯帶着雅典娜和星矢前往未知領域，而冰河和瞬被傳送回聖域。
下一步的劇情將承接《聖鬥士混沌篇》
