7月9日，一段最新視頻顯示中國調查船在仁愛礁海域遭遇了菲律賓方面的干擾，視頻中，菲律賓士兵多次準備阻擋甚至衝撞中國調查船，我國調查船應對得當，最終完成了所有調查任務，並在海底展開了五星紅旗，這是我國五星紅旗首次在仁愛礁海底飄揚，意義重大。
菲律賓在仁愛礁擱淺了一艘破艦，這一行為已持續了25年，我國態度明確要求菲律賓撤走，但菲律賓始一直沒有履行承諾，從時間線上來看，菲律賓對這艘擱淺的破船進行了多次加固，明顯是想將長期留在仁愛礁，我國對菲律賓已是仁至義盡，中方指出擱淺的菲律賓破船是導致仁愛礁海域生態惡化的罪魁禍首。
菲律賓海警9701號巡邏艦滯留了達兩個半月之久，中國海警局派出了排水量達1.2萬噸的海警5901船前往南沙群島仙賓礁水域，由於該船排水量巨大，被菲媒稱為「怪物船」，菲律賓聲稱，中國此舉是為了嚇唬滯留在仙賓礁水域內的菲海警「特里薩·馬格巴努亞」號巡邏船，卻不知道中國海警另有深意。
中國海警5901船從海南三亞港啟航，直奔南沙群島，5901船經過仁愛礁和美濟礁，最終駛向仙賓礁水域，菲律賓海警多次準備喊話驅離，但中國海警5901船始終沒有理會，繼續在仙賓礁水域依法巡邏和護航。
中國海警5901船的強大實力為這次對峙提供了堅實後盾，該船全長170米，標準排水量9000噸，滿載排水量達12000噸，裝備有76毫米艦炮、30毫米機關炮和12.7毫米高射機槍，續航能力和適航性優越，不需頻繁補給，完全可以與菲海警「特里薩·馬格巴努亞」號巡邏船對抗到底。
在我國調查員進行科學調查期間，情況並不順利，我國科學調查小組乘坐4艘調查快艇，從不同方向對海水和珊瑚進行採樣分析，菲律賓迅速派出兩艘充氣快艇進行干擾，8名士兵一邊拍攝一邊在中方調查船附近游弋。
從菲律賓士兵的行動來看，他們似乎故意想衝撞中國調查船，可能還想撞翻，面對險情，我國舵手進行了應急處理，當菲律賓士兵發現中國調查員已經潛入水下進行調查時，他們也潛入水下準備干擾，但最終我國調查員成功完成了任務，並在水下展開了五星紅旗。
我國已經有證據表明菲律賓擱淺的軍艦破壞了仁愛礁的生態系統，中國應對菲律賓發出最後通牒，要求立即撤走，如果菲律賓繼續頑固不化，不承認責任，我國完全有理由採取更強硬的措施，包括主動清理這艘擱淺的軍艦。
