自空氣消毒機問世以來，人們對攻克空氣污染、改善室內空氣質量有了較大的提升。隨著各種不同消毒因子逐漸應用到空氣消毒機上，如臭氧、等離子、紫外線、光觸媒等。隨之因消毒因子的不同就有了等離子空氣消毒機、臭氧消毒機、紫外線消毒機等等的分類。儘管越來越多的消毒因子運用到空氣消毒機上， 甚至將多種消毒因子集中在同一空氣消毒機上，以及將過濾器應用至空氣消毒機中。但空氣消毒機的基本消毒原理大致相同，在電機的作用下使室內空氣形成氣流，經過空氣消毒機內部的凈化系統和消毒系統時，就能將空氣中的顆粒污染物、氣態污染物以及其他有害微生物除凈。對於殺菌滅毒，每一種消毒因子的特性都有較明顯的差異性。
等離子空氣消毒機，是指等離子發生器在特定條件下產生大量電子，這些電子遊離、擴散至空氣中，大量電子對微生物細胞壁等細胞器產生破壞作用。等離子空氣消毒機的使用時間不宜過長，空氣中電子濃度超過一定範圍時，對人體健康並無益處。
臭氧空氣消毒機，是利用臭氧的強氧化性來破壞微生物的細胞結構，進而實現殺菌滅毒的作用。通過制臭氧設備產生臭氧，臭氧飄散在室內的各個角落。臭氧消毒機的運行時的注意事項有：禁止非專業人員在消毒現場，因為臭氧的氧化性對人體的細胞結構也有較強的氧化作用；在臭氧消毒機工作時需緊閉門窗，因為臭氧極易變為氣態的臭氧，並且分解成氧氣。
紫外線空氣消毒機，是利用波長為254nm紫外線進行殺菌滅毒，這個波長的紫外線對博威生物的DNA或RNA有破壞作用，致使很多微生物失去繁衍的功能，或是直接將微生物殺滅，實現殺菌滅毒的作用。紫外線既有殺菌滅毒的作用，同樣也對人體的皮膚有影響，當皮膚在陽光下暴晒一段時間後，表皮會被晒傷甚至脫皮，原因是陽光中也有紫外線。因此，在使用紫外線空氣消毒機時，要防止紫外線泄露，以免使皮膚受傷。
綜合來看，常見的消毒因子主要有：臭氧、紫外線、等離子、光觸媒等。越來越多的空氣消毒機不再是單一的消毒因子，結合多種消毒因子於一體，以及過濾器的空氣消毒機逐漸在家庭、辦公室等場所應用。
