Cell | 細胞的“身份危機”:研究揭示加速衰老的“間充質漂移”,逆轉密碼藏於“山中四因子”

2025年08月25日17:00:22 科學 8584

引言

衰老,是生命體最普遍也最神秘的現象之一。它如同一位技藝高超的雕塑家,在我們身上刻下時間的印記:皮膚失去彈性,器官功能逐漸衰退,對疾病的抵抗力也日漸減弱。我們常常將衰老理解為一個緩慢的、不可逆的損耗過程。但如果,衰老的背後隱藏着一個更主動、更具方向性的變化呢?一個普遍存在於我們體內,悄然改變細胞“身份”的進程?

8月14日,《cell》的研究報道“prevalent mesenchymal drift in aging and disease is reversed by partial reprogramming,研究人員發現了一種被稱為“間充質漂移”(mesenchymal drift, md) 的現象,它像一個幽靈,貫穿於人類的衰老和多種年齡相關疾病中。這不僅為我們理解衰老的本質提供了全新的視角,更巧妙地展示了如何利用細胞重編程技術,讓這些“迷失”的細胞找到回家的路。

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無處不在的陰影:揭開“間充質漂移”的神秘面紗

一個高度組織化的社會,每個公民都有明確的職業和分工,各司其職,整個社會才能高效運轉。我們的身體,就是一個由數萬億細胞組成的精密社會。上皮細胞 (epithelial cells) 像訓練有素的建築師,構建起器官的屏障和結構;內皮細胞 (endothelial cells) 則是高效的物流管理者,鋪設了生命的血管網絡。然而,隨着時間的流逝,一些細胞似乎開始“忘記”自己的本職工作,它們的行為舉止,開始向另一類細胞——間充質細胞 (mesenchymal cells)靠攏。

間充質細胞,可以比作是身體里的“游牧民族”或“維修工”,它們具有更強的遷移和重塑能力,在傷口癒合、組織修復等過程中扮演着關鍵角色。這種從高度分化的“定居”狀態向上皮-間充質轉化 (epithelial-mesenchymal transition, emt) 的過程,在胚胎髮育和組織修復中是正常且必要的。但是,如果在整個生命歷程中,這種轉化變得無序、持續且普遍,會發生什麼?

這正是該研究的核心發現。研究人員通過分析“基因型-組織表達”(genotype-tissue expression, gtex) 的龐大數據庫,對來自 46種不同人體組織 的基因表達數據進行了深入挖掘。他們發現了一個驚人的一致性規律:在絕大多數組織的衰老過程中,與上皮-間充質轉化 (emt) 相關的基因通路都表現出顯著的活躍(上調)。這種趨勢非常穩固,即便在校正了性別和樣本缺血時間等干擾因素後,依然清晰可見。

與此同時,許多維持細胞正常功能的通路,如負責能量代謝的氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation) 和三羧酸循環 (tca cycle),以及膽固醇生物合成 (cholesterol biosynthesis) 等,則普遍表現出活性下降(下調)。這一升一降,清晰地描繪出衰老細胞的功能圖景:它們一方面變得“懶惰”,能量生產效率降低;另一方面,卻又變得“躁動”,開始顯現出間充質細胞的特徵。

研究人員巧妙地將這一現象定義為“間充質漂移”(mesenchymal drift, md)。它不僅僅局限於上皮細胞,還包括內皮細胞、周細胞 (pericytes)巨噬細胞 (macrophages) 等多種細胞類型。這些細胞彷彿在經歷一場集體性的“身份模糊”,它們並未完全轉變為另一種細胞,而是在原有身份的基礎上,疊加了間充質的“屬性”,導致其原始功能受損,同時獲得了包括改變細胞外基質 (extracellular matrix, ecm)、影響組織硬度、分泌炎症因子等新能力。這種普遍存在的“細胞狀態漂移”,暗示着它可能是驅動器官功能失調和衰老進程的一個根本性機制。

漂移的共犯:在疾病惡化中,md扮演了什麼角色?

既然間充質漂移是衰老的一個標誌,那麼在與衰老密切相關的疾病中,是否也能找到它的蹤跡?研究人員將目光投向了那些困擾老年群體的頑疾,試圖尋找md與疾病進展之間的關聯。

肺部的“纖維化疤痕”
特發性肺纖維化 (idiopathic pulmonary fibrosis, ipf) 是一種致命的年齡相關疾病,患者的肺部會逐漸被疤痕組織取代,最終導致呼吸衰竭。研究人員分析了ipf患者的肺部樣本,發現與健康對照組相比,其md相關基因的表達水平顯著升高。

為了探究這背後的細胞層面的變化,他們利用單細胞測序技術 (single-cell rna sequencing) 對超過 30萬個肺部細胞 進行了分析。結果揭示了一個“雙重打擊”的景象。一方面,ipf患者肺部的細胞組成發生了劇變:負責氣體交換的關鍵細胞,如肺泡i型 (at1) 和ii型 (at2) 上皮細胞數量顯著減少,而間質基質細胞 (stromal cells) 的比例則相應增加。另一方面,在那些“倖存”下來的上皮細胞以及各類基質細胞中,md基因的表達也普遍上調。這意味着,肺纖維化的發生,不僅是因為“建築師”(上皮細胞)數量少了,更是因為留下來的“建築師”和周圍的“維修工”(基質細胞)都開始“不務正業”,共同參與了組織的破壞性“重建”。

肝臟的“硬化”之路
在肝臟疾病中,研究人員也發現了類似的規律。他們聚焦於代謝功能障礙相關的脂肪性肝病 (metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease, masld) 及其更嚴重的階段——脂肪性肝炎 (metabolic dysfunction-associated steatohepatitis, mash)。結果顯示,md的水平與肝病的嚴重程度密切相關。在健康的肝臟或早期肝病中,md基因的表達水平相對較低;然而,一旦疾病進展到晚期mash(纖維化分期為f2-f4),md水平便會急劇飆升

單細胞層面的分析進一步揭示,在肝臟纖維化的進程中,肝臟內的內皮細胞和肝星狀細胞 (hepatic stellate cells, hscs) 是md上調最顯著的細胞類型。這與已知的肝纖維化機制高度吻合,因為肝星狀細胞的激活和轉化為肌成纖維細胞 (myofibroblasts) 正是肝臟“硬化”的關鍵步驟。md的上調,很可能就是推動這一病理過程的“油門”。

遍及全身的“漂移”信號
除了肺和肝,研究人員還在更多年齡相關疾病中追蹤到了md的足跡。在慢性腎病 (chronic kidney disease, ckd) 患者的腎小球和腎小管中、在心肌病 (cardiomyopathy) 患者的心臟組織中、在阿爾茨海默病 (alzheimer's disease, ad) 患者大腦的特定細胞中,甚至在衰老的皮膚中,都觀察到了md的顯著上調。

這些來自不同器官和疾病的數據,共同指向一個結論:間充質漂移並非某個器官的“專利”,而是一個在衰老和多種年齡相關疾病中普遍存在的、系統性的生物學現象。它像一個潛伏的共犯,在各種病理過程中推波助瀾。這不禁讓人思考一個更深層次的問題:這種漂移僅僅是疾病的“結果”,還是導致臨床結局惡化的“原因”?

生死攸關:md的臨床“含金量”有多高?

要回答這個問題,就需要將md與最“硬核”的臨床指標(患者的生存率)直接掛鈎。研究人員巧妙地選擇特發性肺纖維化 (ipf) 患者作為“概念驗證”(proof of concept) 的模型,進行了一項震撼人心的分析。

他們根據患者肺泡灌洗液 (bronchoalveolar lavage, bal) 細胞中md基因表達水平的高低,將132名ipf患者分為了高、中、低三組,並追蹤他們的生存時間。結果清晰地展示了md的“生死判官”角色:

低md組的患者,中位生存時間長達 1027天中md組的患者,中位生存時間驟降至 604天而高md組的患者,中位生存時間僅為 294天

更驚人的是,如果比較表達水平最低和最高的極端個體,其生存時間差異超過了 40倍(分別為2498天和59天)。這一數據有力地表明,md的程度與ipf患者的死亡風險呈強烈的負相關。它不再是一個抽象的分子生物學概念,而是可以預測患者生死的強有力的生物標誌物 (prognostic marker)

那麼,是什麼在驅動這種全身性的漂移呢?研究人員將目光轉向了血液,這個連接全身器官的“信息高速公路”。他們分析了血漿蛋白質組數據,發現在衰老過程中,血漿中水平升高的蛋白質,其相關功能恰好高度富集在emt通路中(調整後p值為2.7x10⁻¹⁸)。

更有趣的是,他們進一步分析了與全因死亡率相關的血漿蛋白。結果發現,那些與死亡風險強相關(風險比 hazard ratio > 1.1)的蛋白質,其功能同樣顯著富集於emt通路。相比之下,那些與死亡風險弱相關的蛋白質,則更多地與炎症和腫瘤壞死因子-α (tnf-α) 信號通路相關。這個巧妙的區分說明,驅動死亡風險的,並不僅僅是籠統的“慢性炎症”(inflammaging),而是一種更具特異性的、以emt為核心的間充質漂移過程。這暗示着,循環系統中的某些因子可能正在全身範圍內“廣播”衰老和漂移的信號,將一個器官的衰老“傳染”給其他器官。

撥回生命的時鐘:“部分重編程”的逆轉魔法

既然md與衰老和疾病的預後如此密切,一個大膽而令人興奮的想法便應運而生:我們能否逆轉這種漂移,從而延緩衰老,治療疾病?研究人員想到了著名的“山中四因子”(yamanaka factors),即oct4, sox2, klf4, 和 myc (oskm)。這四個轉錄因子能夠將已經分化的體細胞“重編程”為具有無限潛能的誘導多能幹細胞 (induced pluripotent stem cells, ipscs),這一過程堪稱生命科學的奇蹟。

有趣的是,細胞重編程的早期階段,恰好涉及一個與md相反的過程——間充質-上皮轉化 (mesenchymal-epithelial transition, met)。那麼,是否可以利用重編程的“部分”過程,在不將細胞完全變回幹細胞的前提下,僅僅“糾正”它們的間充質漂移,實現“返老還童”呢?

為了驗證這一設想,研究人員進行了一項精巧的體外實驗。他們取來一位96歲高齡捐贈者的皮膚成纖維細胞 (fibroblasts),並誘導oskm因子的表達,然後在不同時間點通過單細胞測序技術,繪製出細胞重編程的完整軌跡圖。

軌跡分析揭示了細胞命運的三條路徑:一條通往最終的多能幹細胞狀態;一條是“無動於衷”的未重編程狀態;而第三條,也是最關鍵的一條,是進入了一個短暫的“部分重編程”(partially reprogrammed) 狀態。

在這個“部分重編程”的窗口期,奇妙的事情發生了:md的“剎車”,在誘導oskm表達的最初3天內,核心間充質基因和tgf-β通路相關基因的表達水平均被顯著下調;身份的“校準”,此時代表上皮特徵的基因尚未開始穩定上調,表明抑制md是發生在向多能性轉變之前的一個早期、獨立事件;衰老的“逆轉”,處於部分重編程狀態的細胞,其整體基因表達譜發生了顯著的“年輕化”逆轉,衰老的轉錄組特徵被有效抹去。

研究人員還比較了來自22歲年輕捐贈者和96歲年老捐贈者的成纖維細胞在重編程過程中的差異。他們發現,老年細胞的起始md水平更高。在oskm誘導下,老年細胞中md的下降幅度比年輕細胞更為劇烈,這表明部分重編程對於“糾正”衰老細胞的異常狀態可能更為有效。

在體內逆轉“漂移”的現實與挑戰

體外實驗的成功固然鼓舞人心,但真正的考驗在於,這種逆轉效應能否在複雜的生命體內實現。研究人員通過分析多個已發表的體內重編程小鼠模型的數據,給出了肯定的答案。

在一項長期研究中,研究人員對自然衰老的小鼠進行了長達7個月的周期性、系統性的oskm誘導(用藥2天,停葯5天)。結果顯示,在這些經過“部分重編程”治療的老年小鼠中,腎臟和肝臟這兩個在衰老過程中纖維化最顯著的器官,其md基因表達水平顯著下降

在另一個針對早衰症 (progeroid) 小鼠模型的研究中,通過腺相關病毒 (aav) 遞送oskm因子,僅75天的治療就足以顯著降低骨髓中的md水平,並使造血細胞群向年輕狀態轉變。

為了進一步精確到細胞類型,研究人員還分析了在小鼠腸道和胰腺中進行部分重編程的數據。在腸道中,僅4天的oskm誘導就足以降低多種上皮細胞的md水平。而在胰腺中,由於oskm誘導時間更長(7天),反應則更為複雜,這提示部分重編程的效果可能存在細胞類型和作用時間的依賴性。

這些來自不同組織、不同模型的數據,共同證實了部分重編程在活體動物內逆轉間充質漂移的強大潛力。它表明,我們不僅能在培養皿里“編輯”細胞的年齡,更有可能在生命體內啟動一個“系統性”的年輕化程序,通過抑制md,改善組織功能,對抗衰老。

不止於“返老還童”:對細胞身份和生命韌性的再思考

這項發表於《細胞》的研究,其意義遠不止於發現了一種新的衰老標誌物或一種潛在的抗衰老療法。它為我們思考衰老、疾病與生命可塑性的關係,提供了一個深刻而富有啟發性的理論框架。

“間充質漂移”這一概念,巧妙地將看似無關的多種年齡相關疾病——從器官纖維化到神經退行性疾病,聯繫在了一起。它揭示了這些疾病背後一個共同的細胞層面機制:細胞身份的喪失與混亂。衰老,或許不只是被動的磨損和衰退,更是一個細胞逐漸“迷失自我”、功能發生“漂移”的主動過程。

研究中提出的模型,描繪了一個潛在的“惡性循環”:反覆的組織損傷和修復,導致成纖維細胞持續激活,細胞外基質變硬,並釋放出大量的促纖維化和促炎症因子(如tgf-β)。這種“惡劣”的微環境,反過來又會加劇更多細胞的間充質漂移,最終使組織陷入一種慢性的、無法解決的“准修復”狀態,這便是纖維化和衰老的病理本質。而部分重編程的巧妙之處在於,它能精準地切入這個循環,通過抑制md,打破這個惡性循環,讓細胞重新找回“年輕”的身份和功能。

當然,前方的道路依然漫長。md究竟是衰老和疾病的“始作俑者”,還是僅僅是一個“幫凶”?我們能否在疾病早期就檢測到md信號,並進行干預?除了“山中四因子”這種“廣譜”的重編程工具,我們是否能開發出更精準、更安全的“md抑製劑”,靶向性地逆轉特定組織的細胞漂移,而避免全身重編程可能帶來的風險?

無論如何,這項研究已經為我們打開了一扇新的大門。透過這扇門,我們看到的不再是衰老單向流逝的悲觀圖景,而是一個充滿動態、可塑性和潛在干預機會的生命過程。對細胞身份的堅守與漂移的理解,或許正是我們破解衰老之謎、提升生命韌性的關鍵所在。未來的醫學,可能不再僅僅是修復損傷的器官,更是要學會如何“提醒”那些迷失的細胞——嘿,是時候回家了。




參考文獻


lu jy, tu wb, li r, weng m, sanketi bd, yuan b, reddy p, rodriguez esteban c, izpisua belmonte jc. prevalent mesenchymal drift in aging and disease is reversed by partial reprogramming. cell. 2025 aug 11:s0092-8674(25)00853-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.07.031. epub ahead of print. pmid: 40816266.


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