水晶蝦作為觀賞性水族生物現在炙手可熱，養水晶蝦的人越來越多，但水晶蝦的高死亡率卻讓眾多愛好者望而卻步。
水晶蝦死亡原因由很多，但不外乎是以下幾種情況引起的：
1、自相殘殺
水晶蝦常常會自相殘殺，尤其在飼養密度太高的情況下，被攻擊的對像往往是剛脫完殼的個體。剛脫殼的個體由於身上帶有些許的腥味而引來同類的攻擊。
預防方法：密植水草，讓蝦子有隱密之處所，以躲避別的蝦子的攻擊。
2、凍死
水溫太低將影響水晶蝦的活動力，蝦子的體溫極限為10攝氏度，低於10攝氏度很容易導致蝦子死亡。
預防方法：使用恆溫器，用來自動控制魚缸中的溫度，可以長期保持溫度恆定。
3、渦蟲之攻擊
渦蟲主要寄生於蝦子的皮膚上，使蝦子的呼吸功能受到嚴重破壞，引起鰓組織增生及分泌大量粘液，這使得水中的臟物容易粘附在鰓絲上，因此肉眼觀察，嚴重時蝦子呼吸困難，呈缺氧狀在水面漫遊，不久死亡。渦蟲病的感染和水晶蝦的健康狀況密切相關，如果水晶蝦健壯，則感染率低，一旦溫度下降，蟲體從水晶蝦上自然脫落，水晶蝦很快恢復健康。反之，死亡率大大增加，特別是一些平時較瘦弱及營養不良的水晶蝦，更易造成大量死亡。
預防方法：預防渦蟲病可以在網箱中懸掛硫酸銅緩釋片，同時在餌料中添加複合維生素，增強水晶蝦抵抗力。大量寄生時，可以使用「原蟲盡」或「漁經高銅」(皆為硫酸銅、硫酸亞鐵合劑)在早晚投喂餌料時高濃度潑灑葯浴治療。
4、由於跳缸而乾死
如果出現這種情況，建議水槽的水位不能設太滿，約離缸緣六公分以上為佳。
5、抱卵死亡
一般是由水質惡化引起，若蝦子脫殼不完全，也會出現這種情況。
預防方法：可以改用瓷盤養蝦子，如果用的是魚缸，就一定要添加過濾器，過濾出魚缸中的污物，保持水質清潔，起增加氧量凈化水質的雙重作用。
6、休剋死亡
會出現這種情況，一般也是由水質引起的，水的溫度和ＰＨ值不合格，就會致使蝦子非正常死亡。
預防方法：要繁殖出優質水晶蝦，最關鍵的是水質。水晶蝦不同於一般觀賞魚，它對水質非常敏感。在水質選擇方面，最重要的是降低水中「殺手」——例如控制像氨等有害物質的含量，這是使水晶蝦優質的先決條件。由於水晶蝦對水質要求較高，因此缸內水的pH值要控制在5——8之間，KH值(水的相對硬度)在16之間。一般情況下， pH值6.2——6.8， KH值1—2 的條件較為適宜。但若時要注意如果pH值高於7.5也會造成危險。除氯和pH振溫會導致水晶蝦休克或者健康狀況不好，出現到處浮游的現象，嚴重的情況下，水晶蝦會在數小時或數日後死亡。如發現水晶蝦的顏色變淡，便是水質開始惡化的表現。
7、健康狀況不良之個體
要蝦子健康狀況是一件蠻難的事，所謂的不良個體，大至上可以從體色混濁，尾足擺動趨緩來辨別。如果蝦子是由於體質問題死亡，那除了增加母體體質，並沒有更好的辦法。
預防方法：可以通過飲食改良蝦子體質。蝦是雜食性的，基本上以「素」為主： 粒糧、片糧、 紅蟲、 豐年蝦、 苔蘚、 水藻 、 水草、 泥中礦物質、淡水蝦專用糧、有機波菜等都可食用，但是忌食死魚。波菜是水晶蝦最喜歡吃的食物之一，而其他的餌料如水晶蝦專用飼料、冷凍赤蟲(會有帶菌的風險，不建議)、昆布(海帶)或是煮熟的波菜，都是約一星期喂1～2次。若其不肯進食，則代表水質已經改變，要趕緊換水。還有研究指出：水晶蝦除了以素為主，其次就是泥中礦物質， 所以缸底有泥會較好。而幼蝦主要的食物是青藻青苔和水中微小生物。
8、病死
蝦子如果不幸病死，為了避免其他蝦子遭受病菌的感染，最好將死亡的蝦子馬上從水槽中移除。
9、不明原因
這是最危險的訊號，蝦子行動變得遲鈍，然後體色便透明而混濁，不久之後就死亡。
