空气是仙人掌和其他植物茁壮成长的气体来源。正是在晚上，仙人掌通过其景天酸代谢，通过茎中的气孔吸收二氧化碳，并将其储存起来，用于白天的光合作用。然而，在夜间，温室可能会被紧紧关闭，温室中的植物可能需要空气循环或通风。
任何类型的风扇都会使空气循环。通风系统引入新的空气，排出旧的空气。温室也使用通风作为降温的方法。通风风扇应排出足够的空气，以提供8英尺（2.4米）高度每分钟一次的换气量。例如，一个面积为20×50英尺（6×15米）的温室需要的风扇的综合额定容量为每分钟20×50×8=8000立方英尺（6×15×2.4~220立方米）。
温室可以从水平气流风扇中获益，这种风扇设计用于快速移动大量的空气。然而，水平气流风扇价格昂贵，而且通常只推荐用于600平方英尺（56平方米）以上的温室。典型的家用风扇在小温室里就足够了。空气循环风扇一般一天24小时运行。
小型温室可以使用可变速风扇来节省能源，大型温室则需要安装多风扇装置。在冬季的几个月里，只需要正常空气交换量的四分之一。把风扇放在墙上，把进气百叶窗放在对面的墙上。进气百叶窗应至少比风扇面积大1.25倍。风扇和百叶窗的底部应该高出地面约3英尺（1米），以便空气能够植物上方流动。
全自动温控系统调温间隔约为1华氏度（0.6摄氏度），这比传统机械式温控器更好，传统机械式温控间隔通常为5华氏度（2.8摄氏度），比如将机械式空调的温度设定在华氏80度（27摄氏度），它就会使风扇运转，直到气温降到到华氏75度（24摄氏度）停止，这会浪费电和钱。
