动画电影《小王子》根据原著改编，但又不完全是原著里的故事，这部电影更多的是一个小女孩的故事。小女孩的妈妈对她寄予了厚望，她希望小女孩能上最好的学校，为此她们排练了很多遍面试官很有可能会问的问题，然而真正面试时面试官却换了问题，没有准备的小女孩就这样被淘汰了。虽然面试失败了，但是小女孩的妈妈买了一所学区房，这样的话小女孩就可以上最好的学校了。
不过，很快她们就发现隔壁住了一个怪老头，他每天都在捣鼓些奇奇怪怪的东西，甚至还有一架破旧的直升飞机，没有人愿意跟这个怪老头玩。在她们搬来的第一天，怪老头就不小心把他们家砸坏了，因此他赔了一罐硬币。一天晚上，小女孩在写作业的时候，老头从窗户外扔进来一个纸飞机，小女孩打开飞机发现上面写着一个小王子的故事，老头还在纸上写了他想和小女孩做朋友的愿望，不过小女孩不太喜欢怪老头，她拒绝了他。第二天，小女孩整理硬币的时候发现了很多关于小王子的有趣的小玩意儿，她突然来了兴趣。她找到老头，并表示对小王子的故事很感兴趣，愿意和老头做朋友，于是，老头又继续把这个故事讲了下去。
小王子住在一个比他大不了多少的星球b612上，星球上只有他一个人，生活很无趣，他每天所做的事无非就是看日升日落，铲除猴面包树，有一天，风不知从哪个星球上吹来了一粒种子，小王子很开心，他日日用心浇灌，终于长出了一朵玫瑰。小王子和玫瑰很快就相爱了，可是玫瑰就像很多不懂恋爱的少女，总会让另一半伤心，终于，小王子受不了玫瑰的自负离开了她。离开玫瑰后，小王子到了很多星球，他发现成人的世界很奇怪，外面的世界也不过如此。后来他来到了地球上，在这里他遇到了一只狐狸，他想和狐狸做朋友，可是狐狸说只有驯服了它才能和它做朋友。小王子驯服了狐狸，他们愉快地相处了很长时间，小王子在地球上看到了很多玫瑰，他开始想念起自己的玫瑰，于是他决定回去找她。
小女孩和老头相处得越来越好，可是他们不小心闯了祸，小女孩的妈妈也发现了小女孩整天不学习跟怪老头一起玩，她很生气，勒令小女孩好好学习，不许再跟怪老头玩了。老头其实是个飞行员，年轻时有次驾驶飞机时降落到了一片沙漠，在沙漠中遇到了小王子，他所说的故事都是真的。开学前一天，老头身体出现了问题，被送到了医院，小女孩很伤心，她决定为老头找到小王子，满足他的愿望。
小女孩瞒着妈妈驾驶着老头的直升飞机走了，行驶了一段时间，她来到了一个星球，这个星球上没有儿童，全是埋头工作的大人。她在这里找到了小王子，可是此时的小王子什么都不记得了，他变成了一事无成的大人。小女孩发现这一切都是商人搞的鬼，他剥夺了小王子的童年记忆，不仅如此，他还试图夺取小女孩的记忆。一番较量下，小女孩打败了商人，唤醒了小王子的记忆，他们一同驾驶着直升机飞走了。他们来到了b612，然而b612上长满了猴面包树，玫瑰也死了。小女孩很难过，小王子告诉她：“我能看见她，只有用心看才能看得真切。”玫瑰一直活在小王子的心里。
