不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领)

2021年06月11日23:00:47 科学 1362

信号通路是基础科研的精粹所在,而掌握通路浩瀚数据的钥匙就是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)。KEGG——京都基因与基因组百科全书,是日本京都Kanehisa Laboratories根据文献证据手工整理的一个庞大数据库(包括信号通路、基因、疾病、药物等等)。

KEGG有别于其他数据库的一个显著特点就是具有强大的图形功能,它利用直观图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系,简单明了。但初见KEGG也不是这么好用的,因为日本人清奇的脑回路,很(sang)贴(xin)心(bin)的(kuang)在网站里放了16个子数据库。


不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领) - 天天要闻


大多数人看到这里就吓懵了,但其实根本不用方,一般医学科研人员要用的功能很简单。也就是……

1) 根据疾病或者表型找相关通路

2) 根据确定的分子查询相关通路

3) 根据差异分子列表构建通路网络

疾病 & 通路

不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领) - 天天要闻

单分子 & 通路

不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领) - 天天要闻


一组分子 & 通路

不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领) - 天天要闻

通路解读 & 分析

以上内容大家按需取用,找到通路后,课里还讲了对于找到通路后怎么看,通路里的数据要怎么分析。真正的包教包会,一条龙服务。

不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领) - 天天要闻

不做实验,不写代码,巧用数据库发文章(附KEGG教程免费领) - 天天要闻

免费领取方式

后台私信回复“KEGG数据库”免费领取资源教程

科学分类资讯推荐

EBSD应用-孪晶分析——EBSD基础知识 - 天天要闻

EBSD应用-孪晶分析——EBSD基础知识

EBSD基础知识:EBSD应用-李晶分析。大家好,这里是中材检测科普讲堂。·1.形变李晶的识别。通过EBSD技术可以确定材料内部的李晶组织,李晶与基体之间存在特定的对称关系和取向关系。例如在立方晶系金属中,李晶与基体之间可能存在60°111
哈佛大学科学家解开了5.08亿年前奇异节肢动物的百年谜团 - 天天要闻

哈佛大学科学家解开了5.08亿年前奇异节肢动物的百年谜团

研究人员发现,“扩张头盔虫(Helmetia expansa)”有行走的腿和蜕皮行为,这改变了人们对其移动性和生长的假设。一个多世纪以来,寒武纪节肢动物扩张头盔虫一直是个谜。它于1918年被古生物学家查尔斯·杜立特尔·沃尔科特发现,最初被认
刚刚,物理学家实现了“点铅成金”!0.000001秒 - 天天要闻

刚刚,物理学家实现了“点铅成金”!0.000001秒

编辑:犀牛 好困【新智元导读】欧洲核子研究中心(CERN)的大型强子对撞机(LHC)刚刚实现了一项令人震惊的壮举:将铅转化为黄金!这一“点石成金”的过程虽然仅持续约一微秒,且成本高昂,却让17世纪炼金术士的梦想在现代物理学中成真。
合肥市花石榴花开 风动裙裾醉了夏天 - 天天要闻

合肥市花石榴花开 风动裙裾醉了夏天

【来源:合肥在线】“五月榴花照眼明”。近日,不少细心的市民发现,合肥市花石榴花开了,风动裙裾醉了夏天。5月12日,记者走进劳动公园,在一片绿意中,被一朵朵红花吸引,走近一看,原来是合肥市花石榴花绽放了。
图卢兹机械大堂游记|机械巨兽身边理解童话 - 天天要闻

图卢兹机械大堂游记|机械巨兽身边理解童话

图卢兹机械大堂游记|机械巨兽身边理解童话如果说航空博物馆展现的是图卢兹未来与严谨的一面,那么机械大堂(La Halle de La Machine),则是这座城市关于幻想、艺术与工业的另一种表达。这里更像一个充满声音与铁锈味的舞台,主角是那
一眼千年,一步千里 - 天天要闻

一眼千年,一步千里

### 时空压缩:改写人类文明的“魔法沙漏”——从杭州超重力场看未来科技革命想象一下,一杯浑浊的泥水在自然环境中需要沉淀一天才能清澈,而一台机器只需旋转一分钟就能完成分离——这就是浙江大学牵头建设的“超重力离心模拟与实验装置”(CHIEF)
别看它小,这条不到30公分小蛇是虎斑颈槽毒蛇! - 天天要闻

别看它小,这条不到30公分小蛇是虎斑颈槽毒蛇!

你相信吗?不到30公分的一条小蛇却比大多数蛇还可怕!5月10日,沿江派出所抓获了一条小蛇,通过观察确认是含有毒性的——虎斑颈槽毒蛇。当天下午6点,沿江派出所接到张先生报警,其在自家菜园子劳作时,看到一条黑黄相间、头呈扁平三角形状的蛇在菜地里