由本公众号运营的麦族多组学大数据可视化网站Triticeae Multi-omics Center (http://202.194.139.32)，目前已有超过九万次的点击量，用户遍布全球。
令人鼓舞的是，据不完全统计，已经有十几篇论文在文中标注引用了本网站，包括《Nature Communications》（Lu et al., 2020）、《Plant Biotechnology Journal》（Wang et al., 2019；Chen et al., 2020）、《Plant Journal》（Shi et al., 2020）等。
正如陈锋团队最近在《Plant Biotechnology Journal》上的综述文章里对本网站的描述和点评一样：“The Triticeae Multi-omics Center (http://202.194.139.32) provides genome, transcriptome, proteome, and epigenome dataset resources for common wheat and relatives as well as useful tools such as the BLAST, sequence extraction, and the design of molecular markers and primers. It also aligned the flanking sequences of the Wheat 820K SNP array to the Chinese Spring reference genome V1.0”。通过阅读这些文章发现，大家使用本网站最常见有两个目的：一个偏正向遗传学，为了群体分析进行SNP比较和marker设计；另一个偏反向遗传学，主要对所研究的基因进行序列提取和比较、基于转录组和表观修饰组的功能辅助分析等。
今天给大家总结一下，目前麦类多组学网站上的转录组情况。这部分无论是对于正向研究来说-在定位区间中预测候选基因，还是对于反向研究来说-预测基因的功能，都具有重要的意义。
目前网站上比较全的是六倍体小麦的转录组信息，不仅有我们搜集的已发表的数据资源，还有包括复旦大学缑金营教授团队等分享的独家数据。不过目录框里的排序现在略显纷乱，为了方便大家使用，我梳理了一下，主要分为以下几类：
一是中国春等常规品种背景的发育相关转录组：首先是来源于14年和18年Science专刊上整个生命周期的组织特异性转录组；其次一组比较全的数据是关于籽粒发育的转录组，多个版本，非常细；还有一套旗叶相关的转录组，涉及到衰老。另外，还有一套与蜡质发育相关的转录组。
二是抗病响应的转录组：包括赤霉病、锈病、白粉病、Zymoseptoria tritici感染、Xanthomonastranslucens pathogen infection、Pyrenophora tritici-repentis inoculation等，个人觉得抗病相关的转录组非常全，让做非生物胁迫的我好生羡慕O(∩_∩)O哈哈~
三是与非生物胁迫相关的转录组：以温度胁迫最多（多达6套），另外还有干旱胁迫（注意drought和PEG处理的不同）、盐胁迫的转录组。营养胁迫的只有一套磷饥饿的转录组，后面我们还会补充一些。与抗病转录组比较好取样（叶部或根部感染部分）的特点相比，非生物胁迫相关的转录组大家在使用时，一定要主要回到数据来源的文献中，仔细查看取样时间和组织。
四是外源喷施激素相关的转录组：来源于缑金营团队的GA、6-BA、ABA、JA喷施后的转录组。
五是一些涉及特殊遗传材料的转录组，例如携带与不携带Ph1的遗传材料、紫粒小麦、粒重相关的NIL材料、叶绿素缺失的突变体、miR021b过表达系等。
诚然，目前的转录组还不是特别全，一些重要版图还不完整；但是，以小编的切身体验和与国外小麦组学网站比较来看，我们网站的转录组信息已经可以说最全的了（哈哈，不是自卖自夸哦）。我们由衷希望大家可以将自己的转录组（建议是2014年后的RNA-SEQ数据）放在我们网站与大家共享，也欢迎大家看到比较好的转录组文章和数据后，觉得适合放在网站上，告知我们-毕竟我们人数有限，不可能所有数据都看到。
最后强调一下，如果用到我们网站上的数据，引用我们网站我们欢迎，但一定要记得引用原始数据的文献，相关文献信息我们都在对应页面的下面。另外，组学数据的样本（生态型、发育时期、组织、胁迫处理剂量和浓度等）都不见得与你的实验相同，数据只能作为参考，用实时定量等验证才是严谨。
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