打坐是修行的必备功课。南师说打坐时，只需要信受奉行就好了。要相信自己，相信佛所说的话，因为自性本空。只要把腿一盘，一上座，就已经空掉了。不要再去求一个什么空。
因此，第一步，就是盘腿上座，不求空，也不求有。把眼睛闭起来。尽量把思想放空，什么都不去想。现代人都是眼睛耳朵用得太多了。利用打坐的机会，好好的放松身心。
可是一旦闭上眼睛，各种思想都会忍不住的冒上来，这也是很正常的。一个人不可能没有思想，否则就不叫作人了。思想妄念来了，你需要用“正觉”去看住它。不要跟随着这个思想去东奔西跑，而是静静的看着它，你能够知道这个思想来来往往，东奔西跑的那个，就叫做觉性，用自己的觉性去观照这个思想妄念，那么它就会自己来，自己去。不需要进行强压，不需要有一个去除妄念的思想，那么这等于是头上安头，你静静的观照它，妄念自己就走掉了。
如经典中告诉我们的，这些思想妄念是“客尘烦恼”。就像过客一样，来了在这里住下，停留片刻又走了。我们的觉性就是不要去殷勤的招待它，随缘的让它来，让它走。因此，一定要保持自己的觉性，不能睡觉，觉性才是我们真正的主人。如果觉性沉睡了，那么客人就会在里面翻天覆地，你就会觉得越来越烦恼。
这是打坐前面的两步，第一是盘腿静坐，感觉很清静舒服。第二是思想妄念来了，用正觉去观照它。还有第三步，那就是感觉来了。坐的时间长了，真正入静了，酸痛胀麻痒冷热等等感觉都会发生，这是气脉初步的动。这个时候应该怎么办呢？就是一个字：忍。
南师说自己年轻时，初学打坐，也是盘着腿熬不住，袁老师告诉他：“要忍耐一点，多熬一下，多受一分罪，多消一分业力。”就是因为这句话，南师便熬下去了。心里想：连这个腿都降伏不了，还降伏其心？
为了降伏这两条腿，南师一个人关在藏经楼阁上练腿，同时也是炼心，盘起腿来硬熬，心里求菩萨帮忙，大概熬了五六天，那是真痛苦！几天以后，本来痛苦得身子都弯下去了，忽然卡塔一声，腿软了下来，两腿贴得平平的，不想下坐了，舒服得很。
这是南师打坐的亲身经历。十分宝贵。我们要学习的就是南师的这种精神。当你感觉上来的时候，这本来就是生命本能开始发动，如果就因为受不了，岂不是功亏一篑了。
南师告诫大家，不管是什么反应，依然用正觉去看住它，不要加上任何的知识，引导气脉的走向等等，你一引导反而不能成功。要无心于气脉，无心于四大，四大皆空了，气脉也就成功了。
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