科普 | 基因检测常见问题解答

2020年04月21日20:16:15 健康 1089

原标题:科普 | 基因检测常见问题解答

基因检测(Genetic Test)是从染色体结构,DNA序列,DNA变异位点或基因表现程度,提供受检者与医疗研究人员评估一些与基因遗传有关的疾病、体质或个人特质的依据,也是精准医学分析的一种方法。 每一个人的DNA基因都是独特的个人化资讯,造成每一个人的先天体质,健康状况,特征都不相同。 2008年,美国时代杂志曾经把这个革命性技术评选为2008年度最佳创新之首(Best Inovation of 2008)。

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自2000年人类基因体计划完成以来,越来越多的基因功能被解读成功,如今已有700多种基因相关疾病已开发出相应药物及治疗方法。含癌症与许多罕见疾病,其药物的开发与应用都正在进行。目前基因检测的技术已渐成熟,所检测出的基因型除了应用在诊断与治疗之外,甚至能依据数据库的内容经数字化统计方式,预测尚未发生疾病的风险。

基因检测的应用方向

  • 基因检测主要的应用方向包含: 身份鉴识/亲子关系鉴定/追溯祖源
  • 单基因/染色体遗传疾病诊断与带因筛检
  • 临床预防医学:多基因遗传疾病基因检测
  • 临床个体化医疗:药物基因体学
  • 先天体质/特质潜能分析

随着基因检测技术的飞速发展,如今基因检测已经广泛地用于医疗行业的各个领域,体检、防癌筛查、癌症治疗等等。那么癌症病人是不是都必须要做基因检测呢?广义上讲,所有肿瘤患者均可以接受基因检测;从狭义上讲,根据指南推荐,不同的病种、不同的分期、出于不同的目的,不同的患者,适合做不同的基因检测。

1.什么是肿瘤基因检测?

肿瘤基因检测是通过组织、血液、其他体液或细胞对肿瘤患者的DNA进行检测的技术,通过特定检测设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,分析它所含有的各种基因突变情况,从而能针对性地为每位患者“量身定制”一套最合适的治疗方案,最大程度地提高治疗的有效率,减少药物的毒副作用,避免用药不当贻误治疗时机。肿瘤基因检测亦是肿瘤精准医疗的基础。

2.肿瘤基因检测都有什么用?

肿瘤组织或血液基因检测是评估患者使用药物种类和效果判定非常重要的一环,能从分子层面给医生用药予精确的指导,达到提高疗效、降低副反应的效果。

1)选择最有效的肿瘤治疗药物;

2)通过对相关基因的连续动态分析,判定治疗效果及耐药;

3)通过分析基因突变及微卫星稳定性,初步分析肿瘤负荷(TMB)状态、有助于判定免疫治疗药物应用的有效性;

4)检测相关基因的状态,有助于了解肿瘤发生的可能原因。

3. 肿瘤基因检测panel是什么?

Panel 是NGS(二代测序,高通量测序技术)技术发展起来的一个词语,主要指同时检测多个基因、多个位点。几个基因可以是一个 Panel,几十个基因也可以是一个 Panel,几百上千个基因也可以是一个 Panel,组合在一起我们称为“基因套餐”。

4.做肿瘤基因检测的话,是不是panel越大越好?

首先,目前市场上基因公司超过3000家,有部分公司是不靠谱的,需要选择有资质有经验的公司。其次,在真正选择产品(大中小panel)的时候建议大家根据经济条件及患者的情况来选择。比如,一个晚期肺腺癌患者,经济情况一般,只是为了看看,是否有合适的已经在内地上市的靶向药可用,那么只要测一下最常见的那几个基因就可以了。再比如,一个土豪,看看自己是不是有靶向药可用:不管是已经上市还是处于临床试验研究阶段的,不管是国内还是国外,都想知道。那么,他可以选择做尽可能多的、几十上百甚至全部的基因。PS:有经济实力,还是建议尽量做大套餐,比如晚期多处转移的时候,尤其是耐药的患者,基因突变比较复杂紊乱,早做检查避免治疗青黄不接。大套餐还可以检查PD-L1、TMB、MSI及MMR的情况,看看是否适合免疫治疗。

5. 两年前的病理切片如果保存完整能否做基因检测,应该如何选择样本?

疾病是在不断的发展演变的,而且进展速度比较快,如果您想知道现阶段的状况,就最好不要使用多年前的病例证据,两年前的病理切片并不能够如实准确地反映现在的病理状态。肿瘤基因检测样本优先顺序:最近手术或活检新取的组织样本/胸腹水样本>1-2年内的组织标本>最新的血液标本>2年以上的旧组织标本。

6. 送检样本量与样本保存的问题。

新鲜手术组织:黄豆大小,建议使用检验所专用的组织保存液;不建议用福尔马林,如果只能用福尔马林,送检单需标注清楚,检验所收到会安排特定的抽提方法。

穿刺组织,细针需要3条,粗针1条即可。

白片:NGS样本建议15片左右。PCR或者IHC 5片左右。

如果样本量不够或者不符合要求,检验所会要求后续补样。

7. 为什么检测出EGFR阴性的腺癌患者使用易瑞沙治疗有效?

有以下几种情况可能会导致这样的结果:

1) 检测方法灵敏度不一样,是ARMS-PCR,还是NGS? NGS灵敏度更高;

2) 病人的突变丰富比较低,常规灵敏度的检测就会出现阴性结果,但是低丰度的突变对于TKI的治疗也是有效的;

3) 罕见突变,目前,EGFR突变方式大概已经发现了200种,但是临床上常见的检测法仅仅涵盖了最常见的29种,剩下的罕见突变,有一部分是对TKI有效的;

4) 送检标本是有差别的,血液检测还是组织活检检测,如果是血液活检,可能存在一定的假阴性;

5) 肿瘤组织存在异质性,活检的组织刚好是EGFR表达阴性。

8. 什么是肿瘤的免疫治疗?

正常情况下,免疫系统可以识别并清除肿瘤微环境中的肿瘤细胞,但为了生存和生长,肿瘤细胞能够采用不同策略,使人体的免疫系统受到抑制,不能正常的杀伤肿瘤细胞,从而在抗肿瘤免疫应答的各阶段得以幸存。

肿瘤免疫治疗就是通过重新启动并维持肿瘤-免疫循环,恢复机体正常的抗肿瘤免疫反应,从而控制与清除肿瘤的一种治疗方法,包括药物免疫治疗与细胞免疫治疗。

9.肿瘤免疫治疗药物有哪些?

根据治疗方式对肿瘤细胞或组织是否具有特异性,我们将药物免疫治疗总体分为非特异性和特异性药物免疫治疗两部分。非特异性药物免疫治疗没有特别明确的免疫细胞靶点,是从整体上提高人体免疫力从而达到缓解肿瘤症状的药物,又称免疫调节剂,如国内胸腺五肽、中药免疫治疗药物;特异性药物具有明确的靶点与机制,能通过激活或者抑制明确靶点来实现免疫系统对肿瘤的免疫激活,如免疫检查点抑制剂(PD-1/PD-L1抗体药物)。目前FDA批准上市的PD-1/PD-L1抑制剂见下表,目前药企在众多国内三甲医院做临床试验,提供入组名额(需要满足入组条件)。

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10. 免疫检查点抑制剂靶标有PDL1、TMB、MSI、MMR等这几种靶标是否有相关性?

PD1/PDL1为经典的标志物,但是其特异性较低、检测受到干扰因素多,且在消化道肿瘤中表达率低,导致其并非为良好的免疫检查点抑制剂预测标志物。TMB可评估近55%的肿瘤免疫治疗的有效性,是未来潜在的良好标志物。MSI/MMR被FDA批准用于所有实体瘤免疫检查点抑制剂用药指导; MSI本身就是肿瘤突变负荷的一种形式,MSI-H预示这肿瘤高TMB存在。TMB与PD1/PDL1不冲突,二者结合,可更有效预测免疫药物的疗效,故可联合检测。

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