這個基因在超過50%癌症中發生突變!一文看懂攻克它的不同策略

2022年10月14日13:42:31 科學 1145

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TP53是人類癌症中最常見的突變基因之一,據估計,超過50%的癌症都攜帶TP53基因突變。TP53在1979年被首次報道以來,科學家們已經對TP53編碼的p53蛋白進行了深入的研究,然而p53也是腫瘤學研究中最難開發的靶點之一,目前尚未有靶向p53的有效手段獲得FDA的批准。

隨著對p53研究的進一步深入,科學家們正在利用不同手段靶向這一靶點,包括從傳統的小分子藥物,到雙特異性抗體、蛋白降解療法、基因療法和RNA療法等創新治療模式。近日,Nature Reviews Drug Discovery上的一篇綜述對靶向p53的不同手段進行了盤點。

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p53在抑制癌症發生和發展中的作用

野生型p53的主要作用是作為轉錄因子,通過激活一系列基因的表達來限制腫瘤細胞的增殖和存活。此外,p53還具有轉錄因子以外的功能,它與BCL-2家族蛋白的相互作用可以促進線粒體激發的細胞凋亡。p53同時還是自噬作用的重要調節因子,並且能夠影響腫瘤微環境,讓其不利於腫瘤生長。

由於p53在抑制腫瘤生長方面的多重作用,TP53基因也是腫瘤中最常突變的的基因之一。大多數TP53基因突變為錯義突變,導致p53蛋白不能正常行使抑制腫瘤生長的功能。不過也有些突變會讓p53突變體產生促進腫瘤生長的功能,比如激活促進癌細胞生長的基因,降低內質網應激造成的細胞凋亡,改變腫瘤微環境等等。因此,p53是癌症治療方面極具吸引力的重要靶點。

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▲野生型p53和p53突變體的抑癌和促癌作用(圖片來源:參考資料[1])

靶向p53的小分子藥物

針對p53的小分子藥物開發早在20多年前就開始了。由於大部分TP53基因突變導致p53結構的不穩定和功能喪失,靶向p53的小分子藥物開發的主要目標是恢復p53的結構和表達水平,讓p53能行使其正常的抑癌功能。目前正在開發的小分子藥物可以分為三大類:第一類藥物通過靶向p53表達的負調節因子(包括MDM2,MDM4和HPV E6),提高p53的表達水平;第二類藥物通過靶向特定p53突變體,旨在恢復p53突變體的結構穩定性和功能;第三類藥物針對由於TP53基因出現的無義突變而生成的截短p53蛋白。

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▲靶向p53的小分子藥物開發策略(圖片來源:參考資料[1])

靶向p53負調節因子的優勢在於可以對野生型p53產生效果,並具有更為廣譜的效力。比如,亞盛醫藥的MDM2抑製劑APG-115通過與MDM2結合,阻斷MDM2和p53的相互作用,恢復p53的抑癌活性。它已經獲得FDA的多項孤兒葯資格,涉及適應症包括急性髓系白血病、軟組織肉瘤(STS)、視網膜母細胞瘤(RB)、IIB-IV期黑色素瘤等。

此外,蛋白降解療法也可以被用於降解抑制p53的調節因子,從而提高p53的水平。比如,Kymera Therapeutics公司靶向MDM2的蛋白降解藥物KT-253已經在臨床前實驗中,表現出優於MDM2小分子抑製劑的活性。該公司預計在今年年底之前向FDA遞交IND申請。

不過,由於p53在所有細胞中都存在,這些藥物對健康細胞中p53的影響可能帶來潛在的毒副作用。

靶向p53突變體的小分子藥物旨在通過與突變體結合,恢復p53的正常結構和功能。比如,近日在靶向KRAS方面做出突出貢獻的Kevan M. Shokat教授實驗室發表論文,描述了一款與p53 Y220C突變體結合的共價化合物,它可以將其熱穩定性恢復到和野生型p53相當的程度。

這些靶向療法由於針對特定TP53基因突變導致的突變體,因此對野生型p53的影響較小,毒性較低,不過TP53基因具有多種不同的基因突變,靶向特定p53突變體的策略不一定能夠用於其它突變體。

針對由於無義突變產生的截短p53蛋白,目前的策略是使用促進核糖體通讀(read through)的藥物,或者抑制截短p53蛋白降解的藥物來提高p53的水平。不過這些藥物能否有效提高p53的水平仍然需要驗證,並且它們的潛在毒性也是讓人擔憂的問題。

針對p53的免疫療法

由於p53突變體大多在腫瘤細胞中高度表達,因此它們的多肽片段也更有可能被腫瘤細胞呈遞到細胞表面,從而被人體的免疫系統識別。針對p53的免疫療法增強人體免疫系統識別p53突變體的能力,並且激活針對p53突變體的免疫反應,從而消滅表達p53突變體的腫瘤細胞。

這一策略包括基於p53突變體的癌症疫苗,靶向p53突變體的單克隆抗體和雙特異性抗體。比如,去年在《科學》雜誌上發表的一項研究中,由約翰-霍普金斯大學(Johns Hopkins University)學者領銜的研究團隊成功開發出靶向p53突變體的雙特異性抗體療法。它能以極高的特異性,識別突變p53多肽片段與人類白細胞抗原(HLA)蛋白構成複合體。同時,這一雙特異性抗體的另一端可以與T細胞表面的CD3受體結合,激活T細胞殺傷表達p53突變體的腫瘤細胞。這一研究首次提供證據顯示,靶向p53突變體的雙特異性抗體,在細胞表面新抗原表達水平極低的情況下仍然能激活T細胞並消滅腫瘤細胞。

綜述作者指出,這一策略的關鍵在於激髮針對p53突變體的特異性免疫反應。正常細胞也表達p53,雖然大多數細胞p53水平很低,呈遞在細胞表面的抗原更少,但是有些經常分裂的細胞(包括幹細胞和祖細胞)的p53表達水平會升高,避免免疫系統攻擊健康細胞是研究人員需要考慮的問題。

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▲針對p53突變體的抗體療法作用機制(圖片來源:參考資料[1])

針對p53的基因療法和RNA療法

由於大部分TP53基因突變導致p53失活,因此使用基因療法表達具有正常功能的p53也是恢復p53功能的一個重要研發方向。使用病毒載體或者脂質納米顆粒,可以將編碼野生型p53蛋白的轉基因遞送到腫瘤細胞中,恢復正常p53的表達,產生抑癌作用。

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▲在基因和RNA層面針對p53的開發策略(圖片來源:參考資料[1])

隨著mRNA疫苗的成功,利用納米顆粒遞送編碼p53的mRNA也成為藥物開發的方向之一。今年2月,哈佛大學醫學院和麻省總醫院的研究團隊在Nature Communications上發表論文,在肝細胞癌動物模型中,成功使用靶向CXCR4的納米顆粒遞送表達p53的mRNA。這一療法與抗PD-1抗體聯用,有效改變了腫瘤微環境的細胞和分子成分。

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▲表達p53的mRNA與抗PD-1抗體聯用,顯著改變腫瘤微環境(圖片來源:參考資料[2])

這一策略需要注意的一個問題是很多p53突變體不但自身功能缺失,而且由於表達水平升高,可能會起到阻斷正常p53功能的作用。這種情況下,表達正常p53蛋白的效果可能並不顯著。此外,有些p53突變體攜帶著促進癌症的功能獲得性突變,表達正常p53蛋白並不能阻止這些突變體的致癌作用。

基因療法和mRNA療法之外,RNAi可以抑制突變TP53基因的表達,而CRISPR基因編輯系統具有修復TP53基因突變的潛力。

展望未來

綜述作者指出,自2000年以來,多款靶向p53的療法已經進入臨床試驗階段,隨著對p53突變體的進一步了解和篩選手段的進步,近10年來靶向p53的小分子藥物在臨床試驗中的比例大幅度增加。

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▲靶向p53的臨床試驗統計(圖片來源:參考資料[1])

不過開發安全和有效的p53靶向療法仍然面臨多重挑戰,尚未解決的問題包括潛在耐藥性的產生,以及如何與其它療法聯用達到增強的抗癌效果等等。總體來看,靶向p53是一個「高風險/高回報「的歷程,近年來的科學進展正在逐漸讓人們看到靶向這一「不可成藥」靶點的希望。如果獲得突破,有潛力變革癌症治療。




參考資料:

[1] Hassin and Oren, (2022). Drugging p53 in cancer: one protein, many targets. Nature Reviews Drug Discovery, https://doi.org/10.1038/s41573-022-00571-8

[2] Xiao et al., (2022). Combining p53 mRNA nanotherapy with immune checkpoint blockade reprograms the immune microenvironment for effective cancer therapy. Nature Communications, https://doi.org/10.1038/s41467-022-28279-8

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