全基因組綜合分析RNA-DNA互作的技術揭示染色質功能組織的核心

2022年06月28日05:33:11 科學 1571

加州理工學院Mitchell Guttman等研究人員開發新技術-RNA & DNA SPRITE (RD-SPRITE)首次實現了全基因組水平同時分析RNA-RNA、DNA-DNA以及RNA-DNA互作(1)。

全基因組綜合分析RNA-DNA互作的技術揭示染色質功能組織的核心 - 天天要聞

RD-SPRITE技術原理(1)


研究人員通過該技術以及RNA轉錄的干擾等發現核內非編碼RNA普遍參與核內功能結構域的組織。

這些非編碼RNA轉錄後會產生高濃度的聚集,這種聚集的非編碼RNA就像「種子」一樣進一步募集其它調控RNA以及蛋白,進而影響遠程DNA互作、染色質狀態以及基因轉錄。

研究人員認為該項技術捕捉到的多種多樣非編碼RNA作用方式值得進一步挖掘;此外,這種全基因組RNA-DNA綜合互作的分析技術還能用於轉錄對染色質結構的影響以及核外RNA聚集結構的詳細解析

全基因組綜合分析RNA-DNA互作的技術揭示染色質功能組織的核心 - 天天要聞

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01230-7


該項工作2021年11月4日發表在Cell(1)。


同日,Cell還上線來自UCLA Kathrin Plath等研究人員的工作,細緻分析了Xist RNA如何募集蛋白失活X染色體;研究人員結合動態成像數據等提示這可能是一個相分離的過程(2)。

全基因組綜合分析RNA-DNA互作的技術揭示染色質功能組織的核心 - 天天要聞

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01275-7


Comments:

RD-SPRITE技術全基因組水平分析RNA-DNA綜合互作,是非常強大的工具,能獲取獨到信息;將來進一步結合與蛋白互作的信息會能為大家帶來更「全景」的細胞核組織結構。

但是這項技術從原理上看起來很難高質量做到單細胞,畢竟它依賴重複多次接頭連接。

通訊作者簡介:

全基因組綜合分析RNA-DNA互作的技術揭示染色質功能組織的核心 - 天天要聞

https://www.bbe.caltech.edu/people/mitchell-guttman


全基因組綜合分析RNA-DNA互作的技術揭示染色質功能組織的核心 - 天天要聞

https://www.hhmi.org/scientists/kathrin-plath

參考文獻:

1. S. A. Quinodoz et al., RNApromotes the formation of spatial compartments in the nucleus. Cell. 0(2021), doi:10.1016/J.CELL.2021.10.014.

2. Y. Markaki et al., Xist nucleates local protein gradients to propagate silencing across the X chromosome. Cell. 0 (2021), doi:10.1016/J.CELL.2021.10.022.

原文鏈接:

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01230-7

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01275-7

科學分類資訊推薦

米東區:這一電化學儲能電站項目推進中 - 天天要聞

米東區:這一電化學儲能電站項目推進中

(米東區融媒體中心記者:黃鵬報道)7月9日,記者在位於米東區北部沙漠東北部的新疆華電烏魯木齊光伏基地100萬千瓦/400萬千瓦時獨立新型儲能示範項目現場看到,工作人員正在對設備進行吊裝調試。該項目總投資約30億元,是全國單體容量最大的電化學
腦圖譜大科學計劃時機已來!中國科學家十項成果給大腦繪高清地圖 - 天天要聞

腦圖譜大科學計劃時機已來!中國科學家十項成果給大腦繪高清地圖

人類大腦是一個非常複雜的組織,要理解大腦的工作原理首先要了解其中的細胞種類和神經聯接規律,近日中國科學家聯合發布系列成果給大腦繪製「高清地圖」。 7月10日深夜,中國科學家聯合發布介觀腦圖譜系列成果,實現從嚙齒類到靈長類大腦的跨越。10項成果以專題論文集的形式集中發表在國際學術期刊《細胞》《神經元》《發育...
國際突破!中大培育光子「雙胞胎」,輻射強度達單光子水平 - 天天要聞

國際突破!中大培育光子「雙胞胎」,輻射強度達單光子水平

7月9日,《自然》雜誌(Nature)在線發表中山大學物理學院王雪華、劉進教授團隊主導的最新研究成果。該團隊提出了一種全新的腔誘導自發雙光子輻射方案,在國際上率先實現與單光子輻射強度相當的自發雙光子輻射,研發出保真度高達99.4%的按需觸發
微型肝臟,是未來希望,還是科技烏托邦 - 天天要聞

微型肝臟,是未來希望,還是科技烏托邦

文︱陸棄隨著全球器官移植需求持續攀升,傳統器官捐獻嚴重不足的問題愈發凸顯。美國初創企業LyGenesis推出了一個令人振奮的創新方案:通過將供體肝細胞注射至患者體內淋巴結中培育「微型肝臟」,嘗試在患者自身體內製造可替代肝臟功能的器官。
「軟黃金」冬蟲夏草,你真的了解嗎? - 天天要聞

「軟黃金」冬蟲夏草,你真的了解嗎?

冬蟲夏草千年傳承的滋補良藥採藥人的尋覓自公元780年起冬蟲夏草便以其獨特的藥用價值被載入史冊從《藏本草》到《中國藥典》均有記載李時珍更將其譽為「人身不老葯」贊其兼具蟲之陽剛與草之陰柔成為中藥中獨一無二的「陰陽同補」聖品享有「東方聖草」「葯中
【鏈博傳奇】中國中車:塑軌道之「鏈」,與世界同行 - 天天要聞

【鏈博傳奇】中國中車:塑軌道之「鏈」,與世界同行

中國中車集團有限公司(以下簡稱「中國中車」)是中國軌道交通裝備領域的「鏈」主企業,是全球規模領先、品種齊全、技術一流的高端裝備製造商和系統解決方案提供商,清潔能源裝備骨幹企業。當前,中國中車搭建了世界領先的軌道交通裝備產品技術研發平台,構建了完整的軌道交通裝備產業體系,開創了軌道交通裝備和清潔能源裝...
全國AI精英宜賓對決 長江首城創新大賽點燃人工智慧新引擎 - 天天要聞

全國AI精英宜賓對決 長江首城創新大賽點燃人工智慧新引擎

中新網四川新聞7月11日電(吳平華 楊錦 )智匯長江首城,共享成長價值,10日,由宜賓市科學技術局、宜賓市數據局、宜賓市高鐵南片區開發建設指揮部辦公室聯合主辦,北京中關村信息穀資產管理有限責任公司承辦的「長江首城宜創匯」協同創新大賽人工智慧
地質隊日記:塔克拉瑪干腹地,沙丘下出現巨大的圓形結構 - 天天要聞

地質隊日記:塔克拉瑪干腹地,沙丘下出現巨大的圓形結構

記錄人:劉哲,西部油氣地質勘查第六分隊 / 塔里木盆地沙地淺層剖面組成員時間:2023年5月10日地點:塔克拉瑪干沙漠腹地,庫車–民豐剖面中段那是一次平常不過的地震波剖面測線任務,我們團隊負責在塔克拉瑪干腹地沿一條南北走向布點,配合衛星圖像