6日，日本全國知事會在線召開了新型冠狀病毒對策總部會議，會議上，關於疫苗接種，建議要求發布供應量及詳細的接種日程，並提供財政支援，以避免開展體制完善工作的地方政府產生負擔。
此外請求設計不對市町村造成事務負擔的接種狀況管理系統，並支援根據地區實情的舉措，包括在小規模離島向老年人和普通居民同時接種等。
根據日本媒體的報道，日本政府已基本決定了疫情防治的決定手段「全民接種」，從去年10月開始研究如何實施接種對策至今，現在終於有了雛形，日本政府預計從2月15日開始，全國各地按照順序，由各自治體（府、道、都、縣、市、區、村）的指定機構實施接種。
關於疫苗接種計劃，從2月下旬起給徵得同意的約1萬名醫務人員接種，並實施確認身體狀況變化的安全性調查。接下來3月中旬左右將開始對負責新冠診療、搬運相關的醫生、護士、急救隊員、保健所職員等約370萬人進行接種。
預計4月以後開始對老年人進行接種，到6月的第3周結束第2次接種。面向普通人的接種，日本政府設想在5月前後開始。
日本政府目前也在對疫苗接種方式進行調整，不會同時面向老年人發放接種券，而是在自治體內錯開時間發送。為了避免向自治體諮詢和預約接種過於集中而導致混亂的情況，將委託自治體根據地區的實際情況進行裁定。
目前，大阪豐中市、岡山縣等地的保健所已經接到了國家配備的疫苗保存冷庫。
大阪市為應對新接種制度的需要，正在對老齡住民接種即將產生的問題做準備，針對諸多入居老人養護院的高齡者，住民票並未進行登記的問題，已向1026個養老機構發出了入居者名薄記錄的請求。
福島県相馬市，擬在接種時對縣民郵送接種券時，同信封內放入接種意向調配卡片，由接種人填寫基礎疾病等信息後返送，以便更好的把握健康狀態，提升接種現場的工作效率。
埼玉県秩父市由於基礎設施及醫療規模的原因，準備與周邊的5市町共同合作推進接種工作，秩父市保健センターの上田優主幹介紹到，「規模小的自治體單獨實施接種將會產生很大的負擔，聯合實施後建立一個指揮中心，可共享醫師、醫務人員及調配製度，又可以節省費用及人力」，目前相關協調工作正在進行。
東京都在此項工作上將面臨巨大的壓力，由於人群集中人數巨大，在接種場地、醫務人員、疫苗保存等工作上都是很大的難題。東京都練馬區在１月２９日曾發布了一個名為「練馬區模式」的接種方式，引起了政府的關注，厚生勞動省正在向全國自治體推薦此接種模式。根據練馬區相關人員介紹，練馬區擬定將接種工作分為區民個別接種及高齡者集體接種兩個方式同時進行，將與區內250個診所合作實施個別接種，對高齡者及養老設施入住人群將利用區體育館、大型醫院等醫療機構實施集體接種，可短時間內完成集體接種。
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