打坐是修行的必備功課。南師說打坐時，只需要信受奉行就好了。要相信自己，相信佛所說的話，因為自性本空。只要把腿一盤，一上座，就已經空掉了。不要再去求一個什麼空。
因此，第一步，就是盤腿上座，不求空，也不求有。把眼睛閉起來。盡量把思想放空，什麼都不去想。現代人都是眼睛耳朵用得太多了。利用打坐的機會，好好的放鬆身心。
可是一旦閉上眼睛，各種思想都會忍不住的冒上來，這也是很正常的。一個人不可能沒有思想，否則就不叫作人了。思想妄念來了，你需要用「正覺」去看住它。不要跟隨著這個思想去東奔西跑，而是靜靜的看著它，你能夠知道這個思想來來往往，東奔西跑的那個，就叫做覺性，用自己的覺性去觀照這個思想妄念，那麼它就會自己來，自己去。不需要進行強壓，不需要有一個去除妄念的思想，那麼這等於是頭上安頭，你靜靜的觀照它，妄念自己就走掉了。
如經典中告訴我們的，這些思想妄念是「客塵煩惱」。就像過客一樣，來了在這裡住下，停留片刻又走了。我們的覺性就是不要去殷勤的招待它，隨緣的讓它來，讓它走。因此，一定要保持自己的覺性，不能睡覺，覺性才是我們真正的主人。如果覺性沉睡了，那麼客人就會在裡面翻天覆地，你就會覺得越來越煩惱。
這是打坐前面的兩步，第一是盤腿靜坐，感覺很清靜舒服。第二是思想妄念來了，用正覺去觀照它。還有第三步，那就是感覺來了。坐的時間長了，真正入靜了，酸痛脹麻癢冷熱等等感覺都會發生，這是氣脈初步的動。這個時候應該怎麼辦呢？就是一個字：忍。
南師說自己年輕時，初學打坐，也是盤著腿熬不住，袁老師告訴他：「要忍耐一點，多熬一下，多受一分罪，多消一分業力。」就是因為這句話，南師便熬下去了。心裡想：連這個腿都降伏不了，還降伏其心？
為了降伏這兩條腿，南師一個人關在藏經樓閣上練腿，同時也是煉心，盤起腿來硬熬，心裡求菩薩幫忙，大概熬了五六天，那是真痛苦！幾天以後，本來痛苦得身子都彎下去了，忽然卡塔一聲，腿軟了下來，兩腿貼得平平的，不想下坐了，舒服得很。
這是南師打坐的親身經歷。十分寶貴。我們要學習的就是南師的這種精神。當你感覺上來的時候，這本來就是生命本能開始發動，如果就因為受不了，豈不是功虧一簣了。
南師告誡大家，不管是什麼反應，依然用正覺去看住它，不要加上任何的知識，引導氣脈的走向等等，你一引導反而不能成功。要無心於氣脈，無心於四大，四大皆空了，氣脈也就成功了。
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