2023年2月17日,西湖大学施一公及张晓峰共同通讯在nature communications 在线发表题为“mechanisms of the rna helicases ddx42 and ddx46 in human u2 snrnp assembly”的研究论文,该研究揭示了人u2 snrnp 组装中rna解旋酶ddx42和ddx46的作用机制。该研究报道了ddx42-sf3b复合物的冷冻电镜结构和含有ddx42 (ddx42-u2复合物)的17s u2 snrnp的组装前体。ddx42通过n端序列锚定在sf3b1上,其n-plug占据sf3b1的rna通路。ddx42与sf3b1的结合模式与ddx46的结合模式有着惊人的相似。
在ddx42-u2复合物中,ddx42的n端仍然锚定在sf3b1上,但解旋酶结构域已被u2 snrna和tat-sf1取代。通过体外实验,作者发现ddx42和ddx46在与sf3b的结合方面是互斥的。sf3b1的癌症驱动突变靶向rna路径中直接与ddx42和ddx46相互作用的残基。这些发现揭示了ddx42和ddx46在17s u2 snrnp组装中的不同作用,并为sf3b1癌症突变的机制提供了见解。
另外,2023年1月13日,西湖大学施一公、黄高兴宇及曾超共同通讯在current opinion in structural biology 在线发表题为“structure of the nuclear pore complex goes atomic”的综述文章,该综述总结了最近在破译npc分子细节方面的进展,这些进展在快速发展的冷冻电镜技术、x射线晶体学和机器学习支持的结构预测方面得到了极大的进展。最近在冷冻电镜(cryo-em)重建、机器学习支持的结构预测和生化重建方面的突破结合起来,以前所未有的精度生成了npc的分子模型。此外,在细胞冷冻电子断层扫描(cryo-et)结构揭示了npc的实质性结构动力学。这些进步使npc大的组织原则和职能更加清晰。
2023年1月2日,西湖大学施一公团队在cell research(if=46)在线发表题为“lilrb3 is a putative cell surface receptor of apoe4”的研究论文,该研究表明lilrb3是apoe4的假定细胞表面受体。该研究证明apoe4,而不是apoe2,特异性地与白细胞免疫球蛋白样受体b3 (lilrb3)相互作用。lilrb3胞外结构域(ecd)的两个离散免疫球蛋白样结构域识别apoe4的n端结构域(ntd)上带正电荷的表面斑块。该原子结构揭示了两个apoe4分子如何特异性地与两个lilrb3分子结合,通过形成异质四聚体复合物将它们的细胞内信号基元靠近。与生化和结构分析一致,apoe4,而不是apoe2,以lilrb3依赖的方式激活人类小胶质细胞(hmc3)进入促炎状态。总之,该研究确定lilrb3可能是apoe4的免疫细胞表面受体,而不是apoe2,这可能有助于理解apoe亚型的生物学功能和疾病相关性。
最后,inature编辑部结合pubmed及web of science发现施一公团队从2014年到2023年(截至2023年3月23日)在nature (4篇),science (14篇),cell (7篇),cell research (9篇),pnas(15篇),nature communications (3篇),protein cell (3篇)及current opinion in structural biology (5篇)等发表76篇文章(包括综述及研究论文,通讯作者的有68篇文章)(文章后附列表),专注于剪接复合物,核孔复合物及分泌酶等的结构解析。另外,由于时间匆忙,如有错误,可向编辑部反馈。
76篇文章列表如下:
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