导读
国庆假期结束时,我们担心的事情也随之而来——疫情再次多地爆发。
近期,新冠病毒奥密克戎谱系变异株在全球加速流行,包括新起的BA.2.75、BA.4.6、BF.7等变异株,引起世卫组织的广泛关注,最新变异株BQ.1.1也因其突变位点的特殊性走入大众视野。
9月28日,我国内蒙古自治区呼和浩特市发现了首例BF.7确诊病例,6天后,确诊病例达500多人,迄今为止确诊病例已超1200人。
世卫组织发文称BF.7或将掀起新的大流行,我们需引起重视。最近,《自然》杂志也发文提到今年秋冬或有新毒株的流行。这个秋冬全球会陷入新一轮疫情浪潮吗?
李晓韦 | 撰文
9月28日,我国内蒙古自治区呼和浩特市曾报告了1例本土新冠肺炎感染者,经基因测序属奥密克戎BF.7变异株,这是BF.7首次在国内引起本土疫情。
截至10月8日,内蒙古自治区累计确诊1225例。
BF.7毒株从何而来?它会成为新一代“王者”吗?
01
BF.7毒株从何而来?
正当全球迈入秋冬季节,奥密克戎谱系的新变异株并未停下“进化”的脚步,产出了一个又一个新的突变株。
BF.7于5月13日首次在比利时出现,7月16日被命名为BF.7(BF.7是BA.5的一个分支),BF.7在比利时现已占到新增病例的25%。在德国、法国和丹麦,该变异株的病例比例达到了10%。
近期,美国的BF.7病例比例也在两周内迅速增加,超过了其他突变体。根据美国疾病控制和预防中心(CDC)的数据,10月8日时,BF.7病例在美国占比达到4.6%,而BA.5的感染率略有下降,但仍是主流行毒株(79.2%)。
美国CDC公布的各毒株流行率情况
BF.7毒株流行趋势图(绿色)
BA.5近期一直是美国的主流毒株,但它已经逐渐趋于稳定下降趋势了。与此同时,BA.4.6和BF.7逐渐开始增加,BF.7增长速度较快,CDC首次跟踪该变体是在上上周,当时的比例为1.7%,第二周比例为2.6%,当前比例为4.6%,按照这个增长趋势,BF.7的确有成为新一代“王者”的潜力。
02
新出现的毒株,并非仅有BF.7
病毒的增长趋势只是一方面,我们更关心的或许是新毒株的毒性和逃逸能力。
目前与BF.7变异株同时奔跑在流行前线的,还有许多奥密克戎谱系的新兴变异株,我们借助一张图来认识自BA.2之后的变异株大家族。
奥密克戎BA.2及其变体,图源自Marc Johnson
上图非常清晰地描述了自BA.2开始,奥密克戎家族各变异株的来源及重要突变位点。其中,BF.7是由BA.5.2突变而来,突变位点是R346T。
值得一提的是,与BF.7同框的BA.4.6和BE.1.2的突变位点也均为R346T,这符合科学界常提到的一个概念——“趋同进化”。
在这张图中,密苏里大学分子病毒学家马克·约翰逊(Marc Johnson)教授进行了一个假设——刺突蛋白346、444、452、460和486这五个位点,是当前病毒最能适应环境、毒力增益最显著的位点,而BF.7仅拥有其中三个突变位点——R346,L452,F486。显而易见的是,在这张图上最为危险的毒株已变成了BQ.1.1(同时具有上述五个突变位点)。
为探究这样一个庞大的变异家族体系,北京大学教授谢晓亮及曹云龙在bioRxiv上发表了一篇预印本文章,题为“Imprinted SARS-CoV-2 humoral immunity induces convergent Omicron RBD evolution”,文章于2022年10月4日上线。
在这篇论文中,谢晓亮分析了现有新兴变异株的成长优势,确认了多个更具免疫逃逸性的新变异株,进一步确认了病毒正在“趋同进化”的特征。
03
BF.7较BA.5有增长优势且更具逃逸性
奥密克戎BA.1、BA.2和BA.5表现出很强的中和抗体逃逸能力,对人们通过疫苗接种和感染建立起来的免疫屏障构成了较为严重的挑战。
然而,奥密克戎“家族”的规模还在不断扩大。重要的是,这些新兴变异株中有很大一部分比BA.5显示出显著的增长优势,如BA.2.3.20,BA.2.75.2,CA.1,BR.2,BN.1,BM.1.1.1,BU.1,BQ.1.1和XBB。
与 BA.5 相比,具有增长优势的奥密克戎变异株的趋同进化图 图源自论文
值得我们注意的是,尽管这些衍生突变似乎在进化过程中发散,但它们在受体结合域(RBD)上携带的突变收敛于相同的位点,包括R346,K444,V445,G446,N450,L452,N460,F486,F490和R493,符合上述我们所提到的“趋同进化”。
研究证明,上述的“趋同突变”均会导致病毒能显著逃逸血清中的中和抗体,包括来自BA.5突破性感染的康复者血清。进一步的发现,上述突变还能让病毒逃逸现有的抗体药物,包括Evusheld和贝替洛维单抗(Bebtelovimab)。
具体而言,BR.2、CA.1、BQ.1.1、BM.1.1.1毒株,尤其是XBB是试验检测抗体逃逸性性最强的毒株,远远超过BA.5,接近新冠原始毒株的水平。
c-f即假病毒中和滴度
上图数据表明,接种三针科兴后的参试者,以及在接种后分别感染过BA.1、BA.2或BA.5的参试者,体内的抗体对XBB毒株效果差。
这也说明,目前的群体免疫力和BA.5疫苗加强针可能无法为人们提供足够广泛的感染保护力。谢晓亮团队指出,广谱新冠病毒疫苗和NAb药物的开发应成为重中之重,构建的收敛突变体可用于提前检查其有效性。
回到最初的问题,今年秋冬我们会迎来新的新冠疫情浪潮吗?
《自然》杂志的这篇新闻探讨了当前可能推动新冠疫情浪潮的因素,以及各国可以做些什么来减轻奥密克戎带来的影响。研究人员指出,新出现的变异株可能会带来秋冬季新的感染浪潮。
北卡罗来纳大学教堂山分校传染病流行病学家贾斯汀·莱瑟勒(Justin Lessler)表示,针对原始新冠病毒和奥密克戎的二价疫苗推出得“有点慢”,当前种种迹象表明,奥密克戎正在进化并产生新一代的免疫逃逸变体。
“随着我们进入秋季和冬季,这可能会导致一些国家病例的上升,”莱瑟勒补充道。
罗德岛州普罗维登斯布朗大学的流行病学家詹妮弗·努佐(Jennifer Nuzzo)指出,美国一些州已经开始看到病例正在增加。
综上所述,新冠病毒的变异远未结束,毒株的“进化”仍在进行中。广谱疫苗和广谱的药物研发已亟不可待。
参考文献
1.Will there be a COVID winter wave? What scientists say (nature.com)
2.Imprinted SARS-CoV-2 humoral immunity induces convergent Omicron RBD evolution | bioRxiv
3.Tracking SARS-CoV-2 variants (who.int)
4.COVID Data Tracker Weekly Review | CDC
5.CDC COVID Data Tracker: Variant Proportions
6.New Covid variant BF.7 spreading quickly and could be dominant 'within weeks' - Daily Record