同样，抗病毒药物莫努匹拉韦（Lagevrio）于2021年12月获得EUA，用于治疗18岁或以上高危成年人的轻度至中度COVID-19，从症状出现后5天内开始服用5天。
然而，与临床试验中的安慰剂相比，莫努匹拉韦在使患者减少住院方面不如Paxlovid有效。莫努匹拉韦仅授权用于无法获得或临床上不适合获得 FDA 授权的替代COVID-19治疗的患者。此外，虽然Paxlovid被授权用于12岁的儿童，但莫努匹拉韦不被授权用于18岁以下的儿童，因为它可能会影响骨骼和软骨的生长。此外，莫努匹拉韦可阻止SARS-CoV-2复制，但途径与Paxlovid不同，不建议孕妇使用，动物研究表明它可能对胎儿造成伤害。
目前，美国政府已购买310万个疗程的莫努匹拉韦和2000万个疗程的Paxlovid，将于今年交付。
病毒变异，已和早期不一样
今年4月发表的EPIC-HR试验结果（蛋白酶抑制治疗高危患者COVID-19的评估）甚至没有提到反弹，而EPIC-HR试验是Paxlovid EUA的基础。奥密克戎也未被提及，因为没有接种疫苗的试验参与者在奥密克戎出现之前感染了COVID-19。
这项回顾性队列研究在香港进行，重点关注2022年2月26日至5月3日奥密克戎BA.2.2浪潮期间全港近110万名确诊感染SARS-CoV-2的非住院患者。其中，5257例服用莫努匹拉韦，5663例服用Paxlovid。
与不使用抗病毒药物相比，两种抗病毒药物都与较低的全因死亡风险相关——莫努匹拉韦降低39%，Paxlovid降低75%。与不使用抗病毒药物相比，两者还与较低的院内疾病进展风险相关——莫努匹拉韦为36%，Paxlovid为53%。Paxlovid的住院风险降低了31%，而服用莫努匹拉韦的患者的住院风险与未服用抗病毒药物的患者相当。
在香港的研究中，Paxlovid的使用比莫努匹拉韦的使用具有更大和更一致的保护作用，无论疫苗接种状况和年龄如何，Paxlovid的保护作用相似。然而作者指出，研究中Paxlovid明显优于莫努匹拉韦，部分原因可能是65岁以上的患者比例较高，而接受后一种药物的患者完全接种疫苗的患者比例较低。
是药物的问题，还是疾病的问题?
美国CDC与5月24日的健康咨询指出，“症状的短暂复发可能是SARS-CoV-2自然感染的一部分，某些人的复发感染与Paxlovid治疗无关，也无论疫苗接种状况如何。
何大一在5月23日发布的一项研究，公布了大约10人（他是报告中描述的第二个病例）在服用Paxlovid后复阳。当被问及他是否认为复阳可能是SARS-CoV-2感染自然过程的一部分时，他回答说“绝对不是自然过程”。
美国约翰·霍普金斯大学乳腺癌专家Tatiana Prowell从同行处听说过自然病程中出现反弹的病例。她推测，奥密克戎或是根源。
何大一驳斥了辉瑞关于反弹不常见的论点。他和他的合著者指出，他们报告中描述的10例复发中有5例发生在2个家庭中，2个在他的家庭中，3个在另一个家庭中，这表明这种情况并不罕见。
何大一说，这令人担忧，因为似乎经历复发的人可以感染他人。10个病例中，复发期间的病毒载量与最初感染期间的水平相当。何大一和他的合著者写道，在复发期间，1名有症状的患者和1名症状前患者将SARS-CoV-2传播给家庭成员。
试图弄清楚复阳原因
何大一可能是极少数在服用Paxlovid后复发的人之一，然后在第一次和第二次对自己的病毒进行测序。结果显示，何的两种序列都是相同的，排除了他复发的几种可能解释。这不可能是由于运气不好，也就是说就在他第一次SARS-CoV-2感染康复时，第二次感染了。它不可能是由于病毒对Paxlovid产生抗药性，如果是，病毒序列就不会相同。
对于Paxlovid治疗后的反弹，科学家提出了其他一些可能的解释。Carlos 说：“我心中的第一个问题是时机，我认为我们可能治疗太短了。”Wachter推测：“如果你马上开始，也许你会抑制病毒，免疫系统不会像正常情况下那样加速，5天的疗程可能不够长。但Wachter也承认，所有这些理论都毫无意义。
为了回答有关复发的悬而未决的问题，Carlos 说：“我不确定我们是否需要经典定义的临床试验，我们需要批准后的数据，它正在收集中，但调查结果可能要几个月才能获得。目前，没有证据表明，当怀疑在5天疗程后复阳时，需要用Paxlovid进行额外的治疗。
尽管对复阳现象存在大量疑问，但Carlos 说“我们对这种药物的最大挑战是它没有像应有的那样频繁地使用。初级保健医生对药物相互作用感到担忧，COVID-19最有可能发展为严重甚至致命感染的人也是最有可能服用多种药物的人”。
