郭效宗認為針灸學不止是中醫的一門傳統醫術，更是一門具有高度整體觀念的科學，針灸學是將人體和內外環境當作一個完整的整體來對待的。
施針治療時要根據疾病發展的各個階段的實際情況，結合外部環境、氣候，病人的體質和情緒等各個方面進行全面綜合的考量，然後才能選擇最適當的治療手段，所以針灸臨床應用時要做到靈活。
雖然郭效宗是從傳統中醫走出來的針灸大家，但是他卻絕不泥古守舊，他的思維開闊，在傳統的基礎上不斷創新，根據自己多年的臨床經驗總結出了「有效點療法」，應用於臨床後均取得了顯著的效果。
郭效宗於臨床研究發現，有很多疾病是會在人體體表的特定部位出現相應的反應點的，這種反應點就是針刺得「有效點」。
根據性質不同，這些有效點還可以分成良性點、陽性點和陰性點，有效點在人體頭部、頸部、軀幹和四肢等部位廣泛分佈，既是疾病的臨床診斷點，又是針灸治療的有效點。
這些優點都有着可循的規律，主要分佈有七個方面：血管周圍、神經周圍、肌肉周圍、循經分成、相對稱分佈、交叉分佈和上下對應分佈。尋找有效點的方法是在臨床上運用推、揉、按、壓、敲、扣等方法尋找。
不僅如此，郭效宗還在傳統針灸手法基礎上，又提出了針對人體有效點的平、清、溫、補、瀉五種針灸治療手法。
通過反覆的臨床改進，現在針對有效點的刺激方法已經從針刺、艾灸拓展到了推拿、刺絡、挑治等多種治療手法，從而大大提高了臨床治療效果，極大的豐富發展了針灸學的診斷和治療，並將傳統針灸推拿提高到了一個嶄新的高度。
郭效宗平時還筆耕不輟，他先後出版有《針灸有效點圖解》、《針灸臨床治療歌訣》等多部醫學專著，在權威醫學雜誌刊物上發表有各類論文20多篇。
