空氣是仙人掌和其他植物茁壯成長的氣體來源。正是在晚上，仙人掌通過其景天酸代謝，通過莖中的氣孔吸收二氧化碳，並將其儲存起來，用於白天的光合作用。然而，在夜間，溫室可能會被緊緊關閉，溫室中的植物可能需要空氣循環或通風。
任何類型的風扇都會使空氣循環。通風系統引入新的空氣，排出舊的空氣。溫室也使用通風作為降溫的方法。通風風扇應排出足夠的空氣，以提供8英尺（2.4米）高度每分鐘一次的換氣量。例如，一個面積為20×50英尺（6×15米）的溫室需要的風扇的綜合額定容量為每分鐘20×50×8=8000立方英尺（6×15×2.4~220立方米）。
溫室可以從水平氣流風扇中獲益，這種風扇設計用於快速移動大量的空氣。然而，水平氣流風扇價格昂貴，而且通常只推薦用於600平方英尺（56平方米）以上的溫室。典型的家用風扇在小溫室里就足夠了。空氣循環風扇一般一天24小時運行。
小型溫室可以使用可變速風扇來節省能源，大型溫室則需要安裝多風扇裝置。在冬季的幾個月里，只需要正常空氣交換量的四分之一。把風扇放在牆上，把進氣百葉窗放在對面的牆上。進氣百葉窗應至少比風扇面積大1.25倍。風扇和百葉窗的底部應該高出地面約3英尺（1米），以便空氣能夠植物上方流動。
全自動溫控系統調溫間隔約為1華氏度（0.6攝氏度），這比傳統機械式溫控器更好，傳統機械式溫控間隔通常為5華氏度（2.8攝氏度），比如將機械式空調的溫度設定在華氏80度（27攝氏度），它就會使風扇運轉，直到氣溫降到到華氏75度（24攝氏度）停止，這會浪費電和錢。
